Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T7

Slirp, SRA stem-loop-interacting RNA-binding protein, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlirpQ9D8T7 Nod1-201ENSMUST00000060655 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm13347-201ENSMUST00000120298 1353 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm43081-201ENSMUST00000199082 1380 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Cog4-201ENSMUST00000034203 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Tut1-201ENSMUST00000096239 2747 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Mmel1-204ENSMUST00000105635 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Stpg4-202ENSMUST00000186211 591 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ighv5-11-201ENSMUST00000193354 371 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm4657-201ENSMUST00000213839 787 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Fxyd2-211ENSMUST00000216289 668 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Bach1-201ENSMUST00000026703 5867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Thg1l-201ENSMUST00000011398 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Nefl-201ENSMUST00000022639 3380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Abi1-211ENSMUST00000149719 3303 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Slc25a42-202ENSMUST00000110127 3196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Tmprss6-201ENSMUST00000017086 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm43760-201ENSMUST00000202120 3015 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 CT025681.1-201ENSMUST00000225453 1855 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Lclat1-201ENSMUST00000067545 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Birc3-201ENSMUST00000013949 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Parp11-202ENSMUST00000112191 3414 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Daw1-201ENSMUST00000065403 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Olfr5-202ENSMUST00000209866 2980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Katnal2-207ENSMUST00000137354 1482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Pex11g-201ENSMUST00000004686 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm43172-201ENSMUST00000202139 2137 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Zfp608-201ENSMUST00000064763 6112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Slc25a48-201ENSMUST00000021971 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Rps10-202ENSMUST00000114881 604 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm11500-201ENSMUST00000118237 601 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm15131-201ENSMUST00000119124 595 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm22334-201ENSMUST00000158070 133 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm10320-201ENSMUST00000170205 527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm2762-206ENSMUST00000202502 335 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm2762-208ENSMUST00000202976 568 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ssr4-201ENSMUST00000002090 765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 AC122350.1-201ENSMUST00000228135 533 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 1700013F07Rik-201ENSMUST00000029485 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ndst1-201ENSMUST00000169273 6070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm38376-201ENSMUST00000195493 2253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Recql4-201ENSMUST00000036852 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Eef1d-205ENSMUST00000109972 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Slc37a4-207ENSMUST00000215420 2128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Nol6-201ENSMUST00000030138 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Arhgef16-207ENSMUST00000169623 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Arhgef4-204ENSMUST00000159747 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
SlirpQ9D8T7 Lgr5-206ENSMUST00000172806 2652 ntTSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms