Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 AC087891.2-201ENSMUST00000219293 658 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Lyz1-201ENSMUST00000092162 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 AC155245.1-201ENSMUST00000222266 1804 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Cdc37-201ENSMUST00000019615 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm44115-201ENSMUST00000203917 2069 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tubb2a-ps2-201ENSMUST00000221547 1339 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ccdc136-202ENSMUST00000115275 3279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ttll5-205ENSMUST00000110224 4647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rufy2-202ENSMUST00000119567 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Zfp964-203ENSMUST00000204285 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pcdhga10-201ENSMUST00000193404 4732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Brat1-203ENSMUST00000110806 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm44445-201ENSMUST00000204075 2683 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm43713-201ENSMUST00000198251 1896 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Zfp384-201ENSMUST00000046064 3108 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Olfr223-202ENSMUST00000215626 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gal3st2b-202ENSMUST00000178757 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Elf5-206ENSMUST00000164172 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Slx1b-203ENSMUST00000144897 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Cd27-202ENSMUST00000112281 832 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm11658-201ENSMUST00000120913 1008 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 D230022J07Rik-201ENSMUST00000144735 1062 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 1700047K16Rik-201ENSMUST00000145068 886 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm2467-201ENSMUST00000182266 1010 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm6981-201ENSMUST00000182467 1008 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm19963-201ENSMUST00000208413 1255 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Nmral1-201ENSMUST00000074970 1155 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Arhgap36-202ENSMUST00000114904 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Golm1-201ENSMUST00000022039 3954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Uaca-202ENSMUST00000214354 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Dhx34-202ENSMUST00000118795 4076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 4930488L21Rik-202ENSMUST00000212638 3164 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Itih3-205ENSMUST00000227995 2100 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Lman1-201ENSMUST00000048260 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Igsf6-201ENSMUST00000047194 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm3372-201ENSMUST00000198806 1792 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tssk5-201ENSMUST00000071119 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mrpl55-205ENSMUST00000108787 718 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm4986-201ENSMUST00000119731 549 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Tex22-201ENSMUST00000012355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm6548-201ENSMUST00000167498 1165 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ftl1-ps2-201ENSMUST00000169477 549 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 4930516B21Rik-201ENSMUST00000181600 1195 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Polr2d-201ENSMUST00000025106 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Lce3d-201ENSMUST00000059053 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Cx3cl1-201ENSMUST00000034230 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Arvcf-203ENSMUST00000115612 4218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Dclk2-209ENSMUST00000195561 3486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Rbp1-201ENSMUST00000052068 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Doxl2-203ENSMUST00000184917 2468 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm43375-201ENSMUST00000196705 2480 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Hmbox1-201ENSMUST00000022544 3396 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ifi35Q9D8C4 Gm26690-201ENSMUST00000181457 1997 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms