Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7U6

Cldn22, Claudin-22, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn22Q9D7U6 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Sox8-201ENSMUST00000025003 3000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Zfp597-201ENSMUST00000090522 5668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Brd1-202ENSMUST00000109380 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Grm1-202ENSMUST00000105560 4265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rnf144a-202ENSMUST00000062149 4812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pofut1-201ENSMUST00000049863 5600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Trub2-201ENSMUST00000048044 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Aamdc-213ENSMUST00000154853 883 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 4930557F10Rik-201ENSMUST00000155432 630 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm7030-202ENSMUST00000172968 899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm8815-201ENSMUST00000173809 620 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm6114-201ENSMUST00000182472 968 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm37590-201ENSMUST00000193294 603 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm9774-201ENSMUST00000047300 1064 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Olfr462-201ENSMUST00000049743 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Actg-ps1-201ENSMUST00000099636 1124 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Bmp3-201ENSMUST00000031278 6548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tnk2os-201ENSMUST00000141256 1392 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 4930588G17Rik-201ENSMUST00000208075 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm13553-201ENSMUST00000133025 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Cdhr4-211ENSMUST00000177173 2480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm31518-201ENSMUST00000211925 2548 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pck1-201ENSMUST00000029017 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tmem109-201ENSMUST00000038128 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Serpina1b-203ENSMUST00000186166 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Trip4-202ENSMUST00000119245 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rwdd3-205ENSMUST00000106467 1158 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rpl19-ps1-201ENSMUST00000121059 591 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm37695-201ENSMUST00000191765 530 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ddo-207ENSMUST00000216830 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC122876.1-201ENSMUST00000217619 825 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 AC171241.1-201ENSMUST00000228144 1166 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Olfr981-201ENSMUST00000059859 997 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Smtn-203ENSMUST00000075118 3117 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 4932443L11Rik-202ENSMUST00000177130 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Cldn22Q9D7U6 Dennd1c-201ENSMUST00000011623 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms