Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7D7

Cldn23, Claudin-23, mousemouse

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn23Q9D7D7 Cd6-203ENSMUST00000080292 3032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Hcrtr2-203ENSMUST00000184757 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Ints6-202ENSMUST00000223585 10883 ntAPPRIS P1 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Hnrnpa2b1-202ENSMUST00000090002 1662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Rbm6-201ENSMUST00000035201 3999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Arl6ip5-201ENSMUST00000044681 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Arg1-201ENSMUST00000020161 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Clasp1-216ENSMUST00000189738 5373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gripap1-203ENSMUST00000115675 3015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Srebf1-201ENSMUST00000020846 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Serinc4-202ENSMUST00000110613 2240 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm13047-201ENSMUST00000117116 815 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm11700-201ENSMUST00000119409 403 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm15573-201ENSMUST00000119487 540 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm19166-201ENSMUST00000196041 1063 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 0610033M10Rik-201ENSMUST00000204546 506 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm44593-201ENSMUST00000208372 1249 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm34821-201ENSMUST00000208399 1031 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Ldb3-204ENSMUST00000064098 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Trim61-201ENSMUST00000078409 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Fam210b-201ENSMUST00000028995 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm16364-201ENSMUST00000153722 1313 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Npy5r-202ENSMUST00000211920 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Acsl1-202ENSMUST00000110371 2100 ntTSL 5 BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.73□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Sertad2-201ENSMUST00000093292 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Plcd4-204ENSMUST00000113747 2720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gaa-203ENSMUST00000106259 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Slc38a3-203ENSMUST00000177567 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Pcgf2-203ENSMUST00000103149 817 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Tmem135-202ENSMUST00000117852 2986 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Rab15-203ENSMUST00000121716 739 ntTSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm15978-201ENSMUST00000161043 738 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gm6867-201ENSMUST00000219165 425 ntBASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 AC099934.4-201ENSMUST00000220745 523 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Snf8-201ENSMUST00000006217 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Ccdc42os-201ENSMUST00000148019 1335 ntTSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Tbc1d14-204ENSMUST00000130417 2665 ntTSL 5 BASIC9.72□□□□□ -0.85
Cldn23Q9D7D7 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.72□□□□□ -0.85
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