Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V3

Ccdc83, Coiled-coil domain-containing protein 83, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc83Q9D4V3 Gm43633-201ENSMUST00000202455 2330 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Snhg20-201ENSMUST00000145438 459 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm5370-201ENSMUST00000187187 574 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm37922-201ENSMUST00000195596 455 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm44711-201ENSMUST00000205414 1264 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cep112-201ENSMUST00000061287 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm15953-201ENSMUST00000117656 1732 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ces1f-201ENSMUST00000034178 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Heatr6-201ENSMUST00000001002 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ncam1-201ENSMUST00000114476 2567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Prkx-201ENSMUST00000036333 4146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Slc24a1-201ENSMUST00000037798 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Plec-215ENSMUST00000169108 14853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fam71f1-203ENSMUST00000164560 1411 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Susd2-202ENSMUST00000095541 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Mre11a-201ENSMUST00000034405 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ncoa1-209ENSMUST00000220434 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Tdrd1-202ENSMUST00000111604 5187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 AC122367.1-201ENSMUST00000221978 1709 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Phc1-203ENSMUST00000112600 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Pex26-203ENSMUST00000120066 3861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Usp45-202ENSMUST00000065111 6003 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2i-222ENSMUST00000174354 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Nfyc-204ENSMUST00000120779 2006 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Capn3-206ENSMUST00000110721 2898 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Msrb3-202ENSMUST00000130950 561 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm29187-201ENSMUST00000186681 689 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm5781-201ENSMUST00000219792 443 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zfp512-201ENSMUST00000076264 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm10614-201ENSMUST00000181414 2538 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Sec22c-201ENSMUST00000078547 5713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zfp352-202ENSMUST00000107129 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Il17ra-201ENSMUST00000002976 7752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Thsd7b-201ENSMUST00000040311 3895 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Clec4g-201ENSMUST00000058040 1441 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 4930539E08Rik-201ENSMUST00000062357 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm44062-201ENSMUST00000203312 4857 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Lins1-202ENSMUST00000077967 2647 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Cfb-201ENSMUST00000025229 2737 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm15943-201ENSMUST00000147638 3821 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Myo9a-206ENSMUST00000136740 12252 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Zbtb26-201ENSMUST00000067043 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Nek4-203ENSMUST00000226551 4098 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Son-201ENSMUST00000114036 7945 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Upp2-201ENSMUST00000059102 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Mcm3ap-201ENSMUST00000170795 6427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Spats2l-203ENSMUST00000164302 2088 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Gm13437-201ENSMUST00000122434 1981 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 N4bp2l1-205ENSMUST00000202031 1864 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Upk1b-201ENSMUST00000057767 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Ccdc83Q9D4V3 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms