Protein–RNA interactions for Protein: Q9D289

Trappc6b, Trafficking protein particle complex subunit 6B, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc6bQ9D289 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm19744-202ENSMUST00000186135 948 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 1700020N18Rik-201ENSMUST00000188956 547 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm19287-201ENSMUST00000203190 358 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Vdac1-201ENSMUST00000020673 891 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm45433-201ENSMUST00000209386 247 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm32141-201ENSMUST00000220189 488 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm8385-201ENSMUST00000058999 643 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Clec4b2-201ENSMUST00000088455 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ror2-202ENSMUST00000130235 3730 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Mier1-204ENSMUST00000106857 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Trpv1-203ENSMUST00000108470 2667 ntTSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Asb6-201ENSMUST00000041726 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Mab21l1-201ENSMUST00000075422 2492 ntAPPRIS P1 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ptpn21-202ENSMUST00000170188 5562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gne-201ENSMUST00000030201 5384 ntTSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Matn2-205ENSMUST00000227759 3569 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Ptgr2-207ENSMUST00000146377 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Asb15-201ENSMUST00000031696 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 D930020B18Rik-201ENSMUST00000120642 3335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Tcn2-203ENSMUST00000109989 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.94□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Acrbp-202ENSMUST00000088294 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Eps8l1-204ENSMUST00000163893 3868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Isl1-201ENSMUST00000036060 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Spata5-202ENSMUST00000108112 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 AC127242.1-201ENSMUST00000222861 1464 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Trappc6bQ9D289 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 6030443J06Rik-202ENSMUST00000181374 1353 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Smim1-214ENSMUST00000182191 3535 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Dmbx1-203ENSMUST00000124071 4017 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm15411-201ENSMUST00000133243 3488 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Trappc6bQ9D289 Gm27246-201ENSMUST00000183611 1240 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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