Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 4732414G09Rik-202ENSMUST00000180695 408 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm2696-202ENSMUST00000220393 684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 CT025618.1-203ENSMUST00000227008 589 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Eif4ebp3-201ENSMUST00000036765 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Tnfsf9-201ENSMUST00000039490 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Olfr314-201ENSMUST00000076393 1131 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Kyat1-206ENSMUST00000113663 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Bcat2-208ENSMUST00000211173 1684 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Fbxo46-201ENSMUST00000053109 4873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-204ENSMUST00000113512 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-205ENSMUST00000113513 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-206ENSMUST00000113514 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Wdfy1-207ENSMUST00000113515 4551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ceacam1-205ENSMUST00000206171 1722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ajuba-201ENSMUST00000054487 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mospd2-203ENSMUST00000112248 2487 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gata3-201ENSMUST00000102976 3215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cecr2-202ENSMUST00000112686 9212 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Zfp772-201ENSMUST00000074455 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Zfp37-206ENSMUST00000222050 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Hectd1-201ENSMUST00000042052 8988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Slc13a5-206ENSMUST00000208912 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Rai1-202ENSMUST00000090806 7217 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Plcd1-201ENSMUST00000010804 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ndrg2-201ENSMUST00000004673 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Gm14005-210ENSMUST00000225087 1413 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ntng2-202ENSMUST00000071201 1881 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 AC117194.1-201ENSMUST00000224847 3002 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
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Zbed3Q9D0L1 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Pde4d-205ENSMUST00000119507 2163 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 Fbxo18-201ENSMUST00000071564 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Zbed3Q9D0L1 2300003K06Rik-201ENSMUST00000105054 1265 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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