Protein–RNA interactions for Protein: Q9D035

Nkain1, Sodium/potassium-transporting ATPase subunit beta-1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkain1Q9D035 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tfr2-208ENSMUST00000199054 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Prkd1-201ENSMUST00000002765 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 AC158636.1-201ENSMUST00000220118 1393 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Kcnma1-213ENSMUST00000188991 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Qrich1-201ENSMUST00000006851 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tenm3-201ENSMUST00000033965 8961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Syt15-202ENSMUST00000119693 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 AC167022.1-201ENSMUST00000218647 1458 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Zyg11a-201ENSMUST00000043793 2289 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Alg12-201ENSMUST00000043087 1793 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Camta2-205ENSMUST00000119120 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 0610010K14Rik-206ENSMUST00000108576 576 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm6407-201ENSMUST00000176468 549 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm29410-201ENSMUST00000188383 694 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm45460-201ENSMUST00000211385 1038 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Kif1a-203ENSMUST00000171556 5391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Elmod3-204ENSMUST00000141833 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Lingo4-201ENSMUST00000050975 3645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Wnt5a-201ENSMUST00000063465 7010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ttc7-202ENSMUST00000125875 3917 ntTSL 2 BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.63□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm14169-201ENSMUST00000124676 2519 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm26883-201ENSMUST00000180945 4878 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Sec16a-202ENSMUST00000114082 8797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Itgb1bp1-206ENSMUST00000173729 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm5171-201ENSMUST00000214944 1415 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Nop16-202ENSMUST00000148222 790 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Olfml3-204ENSMUST00000169286 874 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Olfr755-ps1-201ENSMUST00000173568 910 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm20400-201ENSMUST00000173695 665 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 1700021P04Rik-201ENSMUST00000178667 659 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm15802-202ENSMUST00000209595 1094 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Proz-203ENSMUST00000211363 984 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Gm30671-201ENSMUST00000214898 318 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Ly6i-201ENSMUST00000023250 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Nkain1Q9D035 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms