Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Cryz-208ENSMUST00000192462 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Slc14a2-202ENSMUST00000163367 1428 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Chmp3-201ENSMUST00000059462 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Bbip1-201ENSMUST00000135402 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm29050-201ENSMUST00000190732 2528 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Lama4-201ENSMUST00000019992 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Adcy6-201ENSMUST00000096224 6038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm44270-201ENSMUST00000203084 1234 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pgpep1l-202ENSMUST00000207874 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cct2-206ENSMUST00000219573 637 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm2822-201ENSMUST00000164299 2910 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm15991-202ENSMUST00000212123 3565 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ntng1-211ENSMUST00000156177 4652 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Txlna-201ENSMUST00000046425 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Bcl2l2-203ENSMUST00000133397 3813 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Papln-202ENSMUST00000121733 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Art3-202ENSMUST00000117108 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Art3-203ENSMUST00000118106 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm37931-201ENSMUST00000194686 2866 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 AU019823-205ENSMUST00000171462 3339 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 AC211878.3-201ENSMUST00000222629 2018 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Tcf4-234ENSMUST00000201410 1915 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm13449-201ENSMUST00000153559 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccdc47Q9D024 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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Ccdc47Q9D024 Gm28516-201ENSMUST00000190257 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Gm2517-201ENSMUST00000215651 348 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Bmp3-203ENSMUST00000200388 6609 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cyp4f16-208ENSMUST00000169591 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 CT009489.1-201ENSMUST00000227740 1893 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Muc3-201ENSMUST00000041226 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rasgrp4-208ENSMUST00000161522 3242 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Rbm8a2-201ENSMUST00000104983 1338 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Ebf2-203ENSMUST00000176161 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Nrf1-219ENSMUST00000167972 1541 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Ccdc47Q9D024 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms