Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXP9

Exo5, Exonuclease V, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Exo5Q9CXP9 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Nr4a2-202ENSMUST00000112627 2400 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Epb42-201ENSMUST00000023987 2695 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Slc9a8-201ENSMUST00000047815 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Epb41l3-202ENSMUST00000112680 4073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Nipbl-201ENSMUST00000052965 8815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 D130017N08Rik-203ENSMUST00000196629 2265 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Hnrnpm-206ENSMUST00000148178 3934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Psapl1-201ENSMUST00000052224 2548 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Hhipl2-201ENSMUST00000065900 2525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Evl-204ENSMUST00000172409 1955 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Fam172a-201ENSMUST00000091459 3892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm4755-201ENSMUST00000181803 2647 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Acat1-201ENSMUST00000034547 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Pdlim2-204ENSMUST00000127836 920 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rps19-ps9-201ENSMUST00000161787 414 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm26759-201ENSMUST00000181773 1251 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm5051-201ENSMUST00000204085 485 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Ifi27-203ENSMUST00000076788 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm10179-201ENSMUST00000086233 688 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 4930523C07Rik-202ENSMUST00000097513 300 ntAPPRIS P1 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Trit1-201ENSMUST00000102649 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Pcgf2-207ENSMUST00000179765 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rnf20-210ENSMUST00000167496 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Galnt9-202ENSMUST00000165856 1541 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Ube2c-201ENSMUST00000001439 2191 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Oscar-203ENSMUST00000148012 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Hjurp-201ENSMUST00000054674 4878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Eef2k-203ENSMUST00000106488 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Fcgbp-203ENSMUST00000138392 7926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Fcgbp-201ENSMUST00000076648 7928 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Slc35a4-202ENSMUST00000050476 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Prdm16-203ENSMUST00000097759 8544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.87□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Topbp1-201ENSMUST00000035164 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 0610038B21Rik-201ENSMUST00000181420 1687 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Trav13d-4-201ENSMUST00000103607 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rbm18-202ENSMUST00000122456 781 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm15954-201ENSMUST00000160746 466 ntTSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm20442-201ENSMUST00000174630 492 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Nkx2-2os-202ENSMUST00000184407 458 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Trav13-4-dv7-202ENSMUST00000184905 264 ntAPPRIS P1 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Olfr368-202ENSMUST00000217299 1200 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Zfp36l1-203ENSMUST00000218835 292 ntTSL 3 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gm18556-201ENSMUST00000219748 1031 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 CT009713.8-202ENSMUST00000224732 385 ntBASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Setd1b-201ENSMUST00000056053 7362 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Gstcd-201ENSMUST00000029651 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Cox15-201ENSMUST00000045562 4798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 A430033K04Rik-203ENSMUST00000198958 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Col6a3-202ENSMUST00000097653 9001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.86□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.85□□□□□ -0.67
Exo5Q9CXP9 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms