Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB8

Ubqln4, Ubiquilin-4, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubqln4Q99NB8 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 AC122408.1-201ENSMUST00000218949 218 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm33677-201ENSMUST00000220074 2765 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 AC160929.1-201ENSMUST00000221247 415 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 H2-M3-201ENSMUST00000038580 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Add1-202ENSMUST00000052836 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Olfr411-201ENSMUST00000080365 1049 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pars2-202ENSMUST00000106781 3046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gtf3c1-201ENSMUST00000055506 6961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gpc5-203ENSMUST00000176912 2837 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pdgfrb-201ENSMUST00000025522 5407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Serpinf2-201ENSMUST00000043696 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pidd1-202ENSMUST00000106005 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Kcnmb4os1-201ENSMUST00000134586 824 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm17231-203ENSMUST00000170133 637 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm45338-206ENSMUST00000211460 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 AC159747.1-201ENSMUST00000219903 265 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 5830428M24Rik-201ENSMUST00000221805 825 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 1700128F08Rik-201ENSMUST00000034483 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Nudt7-201ENSMUST00000066514 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tpp2-201ENSMUST00000087933 4649 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Rbm6-207ENSMUST00000183032 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Kcnma1-205ENSMUST00000145596 12094 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tunar-201ENSMUST00000180458 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Nfx1-202ENSMUST00000091614 3617 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Atp6v0a1-201ENSMUST00000044721 4008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pcdhgb8-201ENSMUST00000195764 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Pde4c-201ENSMUST00000034307 3203 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Trav13-1-201ENSMUST00000103651 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 2900011O08Rik-202ENSMUST00000118412 954 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Ubqln4Q99NB8 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms