Protein–RNA interactions for Protein: Q99LJ7

Rcbtb2, RCC1 and BTB domain-containing protein 2, mousemouse

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Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcbtb2Q99LJ7 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ric8a-201ENSMUST00000026558 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Sh3kbp1-201ENSMUST00000073094 2280 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 4933438K21Rik-201ENSMUST00000175787 1693 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm44190-201ENSMUST00000205083 1401 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Col24a1-201ENSMUST00000029848 7143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Coch-201ENSMUST00000085412 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Col6a4-201ENSMUST00000121963 7371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ccl27a-206ENSMUST00000108037 590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm4819-201ENSMUST00000182170 1009 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm17812-201ENSMUST00000204935 318 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 1700011D18Rik-201ENSMUST00000205762 277 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Mt2-202ENSMUST00000212806 388 ntTSL 2 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 4930564D02Rik-201ENSMUST00000070584 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Exoc3l4-201ENSMUST00000072646 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nmt2-201ENSMUST00000081932 4461 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cttn-201ENSMUST00000033407 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Lrrn4-201ENSMUST00000049787 3715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 4933411K16Rik-201ENSMUST00000164518 1380 ntAPPRIS P1 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Kdelr1-205ENSMUST00000211716 1350 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp462-202ENSMUST00000079605 4684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp646-201ENSMUST00000050383 6310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc43a1-204ENSMUST00000121114 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nhsl1-201ENSMUST00000037341 7321 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11413-201ENSMUST00000155822 1461 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fkbp15-203ENSMUST00000098033 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.49□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Mpl-202ENSMUST00000102671 2934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Asns-202ENSMUST00000115542 2016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 0610037L13Rik-207ENSMUST00000125107 1551 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Rxfp2-206ENSMUST00000201612 2470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm9544-201ENSMUST00000223349 2482 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tmem8b-209ENSMUST00000167153 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cbfa2t2-204ENSMUST00000109725 6080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Zfp384-205ENSMUST00000112424 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ndufa11-201ENSMUST00000002452 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ift46-201ENSMUST00000002099 4169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Fam234b-201ENSMUST00000111915 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tbc1d14-202ENSMUST00000124036 2765 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Srgap3-202ENSMUST00000088373 8887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm11509-201ENSMUST00000117358 325 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm12129-201ENSMUST00000120104 1147 ntBASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Uox-202ENSMUST00000121133 768 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Gm13388-201ENSMUST00000126659 425 ntTSL 3 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Rcbtb2Q99LJ7 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.48□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms