Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Stim1-202ENSMUST00000209255 4362 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Dab2-211ENSMUST00000161812 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Hk3-203ENSMUST00000126234 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 AC113282.1-201ENSMUST00000225278 1707 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Rplp2-202ENSMUST00000106003 449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Art5-203ENSMUST00000106935 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Hint1-202ENSMUST00000117710 580 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ly6l-201ENSMUST00000177479 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ptbp2-210ENSMUST00000198403 389 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm42655-201ENSMUST00000202782 1134 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Pgap2-201ENSMUST00000033292 1201 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Socs6-202ENSMUST00000123826 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Ttll1-201ENSMUST00000016897 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Trim45-204ENSMUST00000134993 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Ciao1Q99KN2 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Dennd4b-201ENSMUST00000098914 5423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm3765-201ENSMUST00000130985 1447 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ppp1r10-202ENSMUST00000087211 4255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Stk31-201ENSMUST00000024171 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cadm1-203ENSMUST00000114547 4444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mir453-201ENSMUST00000104732 82 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Camk2a-205ENSMUST00000115297 499 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Snord23-201ENSMUST00000116828 109 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm14219-201ENSMUST00000120414 288 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm16030-201ENSMUST00000159098 603 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm28836-201ENSMUST00000185842 633 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm9102-201ENSMUST00000219250 465 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Snu13-202ENSMUST00000080622 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Hist1h2bl-201ENSMUST00000091756 381 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Trim11-202ENSMUST00000108809 3522 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Tiam1-214ENSMUST00000164263 3569 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ppl-201ENSMUST00000035672 6277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rtn4ip1-201ENSMUST00000054418 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Dab2ip-204ENSMUST00000112983 6051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Pla2g7-201ENSMUST00000024706 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Vsx2-201ENSMUST00000021665 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Vill-202ENSMUST00000074734 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Lexm-202ENSMUST00000106788 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Maats1-201ENSMUST00000023501 2750 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 4833405L11Rik-202ENSMUST00000222639 2145 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Ddx46-202ENSMUST00000172272 5676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Rnf6-201ENSMUST00000067837 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Platr6-201ENSMUST00000180731 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm14005-209ENSMUST00000224993 1832 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Crygc-202ENSMUST00000114064 612 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm12663-201ENSMUST00000118481 958 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Snord55-201ENSMUST00000174939 79 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm44696-201ENSMUST00000181943 1229 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Ciao1Q99KN2 Gm19013-201ENSMUST00000183895 1222 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms