Protein–RNA interactions for Protein: Q99KG7

Hps4, Hermansky-Pudlak syndrome 4 protein homolog, mousemouse

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Length 671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps4Q99KG7 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Tiprl-201ENSMUST00000043235 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Zufsp-201ENSMUST00000048222 2991 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 A530030E21Rik-201ENSMUST00000199551 1310 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Plscr1-201ENSMUST00000093801 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gpcpd1-204ENSMUST00000110136 3546 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Vrk1-201ENSMUST00000021539 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm12969-201ENSMUST00000120199 1004 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm26982-201ENSMUST00000182250 1151 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm6358-202ENSMUST00000187643 489 ntAPPRIS P5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm9369-201ENSMUST00000196009 733 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Dydc2-201ENSMUST00000022316 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AC113282.2-201ENSMUST00000224012 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AC113282.3-201ENSMUST00000224757 942 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 AC154572.1-201ENSMUST00000226098 1204 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Crisp4-201ENSMUST00000026876 1252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Lta4h-201ENSMUST00000016033 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Pif1-202ENSMUST00000131483 3309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Ffar2-201ENSMUST00000053156 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gm45218-201ENSMUST00000205533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Fam214a-205ENSMUST00000215370 4205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Hps4Q99KG7 Kif1a-201ENSMUST00000086819 5097 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 AC149222.1-201ENSMUST00000154987 5188 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 1500002C15Rik-201ENSMUST00000178987 2183 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Madd-209ENSMUST00000111371 5816 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Madd-210ENSMUST00000111372 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Spem2-201ENSMUST00000056941 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cmklr1-201ENSMUST00000047936 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Tfb2m-201ENSMUST00000027769 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Stx11-201ENSMUST00000042861 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Spaca9-202ENSMUST00000124840 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm13530-201ENSMUST00000134014 390 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm26555-201ENSMUST00000180452 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Rhox3a2-204ENSMUST00000184565 823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Use1-201ENSMUST00000019169 854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 9530034A14Rik-201ENSMUST00000197919 1083 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Asna1-201ENSMUST00000064314 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Rhox3e-201ENSMUST00000081327 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Prss3-201ENSMUST00000096003 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Hps4Q99KG7 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 E2f8-202ENSMUST00000119223 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Egfl6-201ENSMUST00000000412 2704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Lgr5-208ENSMUST00000173740 2508 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Ubap1-201ENSMUST00000072866 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Copz1-201ENSMUST00000100162 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hps4Q99KG7 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
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