Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Fth1-201ENSMUST00000025563 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Lect2-201ENSMUST00000062806 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Chmp3-202ENSMUST00000065364 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm2174-201ENSMUST00000079663 402 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Nudt13-207ENSMUST00000224311 1574 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Emp1-202ENSMUST00000111907 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Ppm1l-201ENSMUST00000029355 9417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Myo1b-201ENSMUST00000018561 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Cxcr5-202ENSMUST00000179828 2824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm15941-205ENSMUST00000140044 1825 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Wipf2-201ENSMUST00000037480 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Rab30-202ENSMUST00000107179 1304 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Src-201ENSMUST00000029175 3906 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm13117-201ENSMUST00000120894 691 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Fbxl12os-203ENSMUST00000138471 2127 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm21778-201ENSMUST00000178779 471 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm17597-201ENSMUST00000181220 1115 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm29155-201ENSMUST00000185910 269 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm43163-201ENSMUST00000196571 442 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 AC122346.3-201ENSMUST00000223983 306 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gpr101-201ENSMUST00000057645 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Otof-202ENSMUST00000114747 6881 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Fyb2-201ENSMUST00000106803 3136 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Zfp558-202ENSMUST00000034647 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 4833422C13Rik-202ENSMUST00000160385 2828 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Synpo2l-202ENSMUST00000117386 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm14025-201ENSMUST00000145798 4242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Rasgef1a-202ENSMUST00000203482 2227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Dlgap1-210ENSMUST00000146730 3936 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Tjp3-205ENSMUST00000219479 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Nemp1-203ENSMUST00000118728 2362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Cd93-201ENSMUST00000099269 6677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 C4a-207ENSMUST00000160679 5371 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Aak1-201ENSMUST00000003710 7203 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm28037-201ENSMUST00000122365 611 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Tmem190-201ENSMUST00000013235 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Rps28-203ENSMUST00000173019 437 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Tlx1-202ENSMUST00000174617 806 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm16740-201ENSMUST00000181819 956 ntTSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm5100-201ENSMUST00000195631 589 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm5298-201ENSMUST00000201122 892 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm3017-201ENSMUST00000203603 1126 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Nmi-201ENSMUST00000028314 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
TrabdQ99JY4 Cmtm2a-201ENSMUST00000034344 1081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.9 ms