Protein–RNA interactions for Protein: Q99J36

Thumpd1, THUMP domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thumpd1Q99J36 Timeless-201ENSMUST00000055539 4457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 A930016O22Rik-202ENSMUST00000208685 2349 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Scamp2-201ENSMUST00000045791 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Efna1-202ENSMUST00000118587 1632 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Saxo2-201ENSMUST00000056728 2783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tmc5-203ENSMUST00000121715 3906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Syne3-202ENSMUST00000095439 3357 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ppp1r17-201ENSMUST00000052827 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zfp366-201ENSMUST00000056558 6382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Slc12a8-203ENSMUST00000119173 2382 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cfb-202ENSMUST00000128767 2751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm11564-201ENSMUST00000105055 691 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm12347-201ENSMUST00000127883 470 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Prox2os-201ENSMUST00000177043 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm4310-201ENSMUST00000177847 889 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm29396-201ENSMUST00000185659 716 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Sox2ot-208ENSMUST00000197103 802 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Txndc17-201ENSMUST00000021158 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rassf5-205ENSMUST00000212202 958 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 AC110091.1-201ENSMUST00000216004 691 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rwdd3-201ENSMUST00000039761 1145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mrpl41-201ENSMUST00000045604 776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mia-201ENSMUST00000071986 566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tiam2-201ENSMUST00000072156 6127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pml-207ENSMUST00000135310 4413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Dmac2-201ENSMUST00000077338 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Slc20a1-201ENSMUST00000028880 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rnf40-206ENSMUST00000206914 3735 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cars-202ENSMUST00000105909 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tyro3-202ENSMUST00000110783 4460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mageb4-201ENSMUST00000096378 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Xpc-201ENSMUST00000032182 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm6124-201ENSMUST00000188240 2580 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Bco1-203ENSMUST00000176860 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pard3-213ENSMUST00000160766 4949 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Zswim9-201ENSMUST00000108532 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tia1-206ENSMUST00000113713 3108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Trim16-202ENSMUST00000072639 1929 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 BC049352-203ENSMUST00000171799 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Styk1-202ENSMUST00000121078 1549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm13652-201ENSMUST00000143898 3412 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cnot8-202ENSMUST00000108843 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Capn5-201ENSMUST00000040971 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Kcne2-201ENSMUST00000047383 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pigq-219ENSMUST00000208071 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Rbm3-ps-201ENSMUST00000121422 465 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm11944-201ENSMUST00000152576 873 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Npff-201ENSMUST00000023814 540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Pcdhga7-201ENSMUST00000192511 4730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Anxa11-202ENSMUST00000112364 1625 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm20757-201ENSMUST00000182870 1604 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Sgk2-201ENSMUST00000018012 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Ntrk3-205ENSMUST00000193002 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Gm16169-202ENSMUST00000162432 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Mamld1-201ENSMUST00000082088 4796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 4933409D19Rik-201ENSMUST00000193674 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Thumpd1Q99J36 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
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