Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N2

Vmn1r188, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r188Q8K3N2 Ccdc170-201ENSMUST00000019901 2151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r188Q8K3N2 E030013I19Rik-201ENSMUST00000148089 2754 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Vmn1r188Q8K3N2 AC130823.1-201ENSMUST00000228929 1549 ntBASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm36975-201ENSMUST00000194105 1828 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Serpine1-201ENSMUST00000041388 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Matn2-202ENSMUST00000163455 3577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Itga2b-201ENSMUST00000103086 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 A530032D15Rik-201ENSMUST00000160792 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Fopnl-201ENSMUST00000023357 1465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 4930484H19Rik-201ENSMUST00000218870 1737 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Trmt10b-202ENSMUST00000107800 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm36991-201ENSMUST00000191800 648 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm37028-201ENSMUST00000194276 107 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm39288-201ENSMUST00000210554 446 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 AC164618.2-201ENSMUST00000224770 573 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Taar8b-201ENSMUST00000092654 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 n-R5s211-201ENSMUST00000093689 119 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Creb3l2-201ENSMUST00000041093 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Msantd1-201ENSMUST00000050535 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Zdhhc6-205ENSMUST00000224291 2603 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 5830437K03Rik-201ENSMUST00000199219 1379 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12940-202ENSMUST00000137236 1970 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Prf1-201ENSMUST00000035419 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Slc10a1-203ENSMUST00000218342 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Ralyl-202ENSMUST00000108373 267 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12194-201ENSMUST00000117756 1012 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm12274-201ENSMUST00000120062 385 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm38389-201ENSMUST00000147871 653 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm16938-201ENSMUST00000180517 464 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm4895-201ENSMUST00000181646 1137 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm28306-201ENSMUST00000191315 529 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm43695-201ENSMUST00000196545 196 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9353-201ENSMUST00000200472 604 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Cdipt-204ENSMUST00000206346 806 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm45338-201ENSMUST00000209198 820 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 mt-Rnr1-201ENSMUST00000082388 955 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Acsf2-201ENSMUST00000103164 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Vmn1r188Q8K3N2 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.3 ms