Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Gm17826-201ENSMUST00000189720 798 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AC126799.1-201ENSMUST00000221976 246 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AC165154.1-201ENSMUST00000226661 340 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm23680-201ENSMUST00000083162 164 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm10775-201ENSMUST00000099425 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm815-201ENSMUST00000099536 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cryz-201ENSMUST00000029850 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Adamts13-201ENSMUST00000014996 3474 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Foxm1-202ENSMUST00000112148 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Usp2-203ENSMUST00000114830 2122 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Pla2g4a-202ENSMUST00000111926 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Prex1-202ENSMUST00000099080 5818 ntTSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Idi1-201ENSMUST00000169314 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Wdr89-201ENSMUST00000062370 2979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Vwf-201ENSMUST00000100941 1807 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Unkl-204ENSMUST00000160896 4787 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Eps8l2-201ENSMUST00000026577 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ly75-202ENSMUST00000112533 6901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ankrd11-202ENSMUST00000098334 8455 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Saa3-202ENSMUST00000210913 2200 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rspo2-201ENSMUST00000063492 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AC140462.2-201ENSMUST00000225718 2433 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Prrx1-201ENSMUST00000027878 4952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Fam53b-207ENSMUST00000106169 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Vbp1-202ENSMUST00000114070 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Dmrtc1a-202ENSMUST00000119624 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm13966-201ENSMUST00000148420 832 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Cmtm2a-203ENSMUST00000212492 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 AC159376.1-201ENSMUST00000218504 630 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ap3s1-202ENSMUST00000224622 978 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rab7-201ENSMUST00000095048 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Piwil1-201ENSMUST00000086056 4016 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Rbm12b1-201ENSMUST00000050069 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Usp44-201ENSMUST00000095333 2946 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Ngef-202ENSMUST00000068681 3109 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.7
SrrdQ8K2M3 Gm28693-201ENSMUST00000189622 2638 ntBASIC10.65□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Atp1a3-205ENSMUST00000196684 3642 ntTSL 5 BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.65□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Usp24-201ENSMUST00000094933 10575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Aurkc-203ENSMUST00000207711 1320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Rnf220-201ENSMUST00000030439 3029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Hars2-206ENSMUST00000152954 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Ecsit-203ENSMUST00000179422 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Fermt3-201ENSMUST00000040772 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gm14942-201ENSMUST00000119642 336 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Mir1956-201ENSMUST00000157748 65 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gm24398-201ENSMUST00000157870 109 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.64□□□□□ -0.71
SrrdQ8K2M3 Gm29292-201ENSMUST00000186169 766 ntTSL 3 BASIC10.64□□□□□ -0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms