Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm18393-201ENSMUST00000208349 1131 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 1110025L11Rik-201ENSMUST00000089104 591 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Flnc-202ENSMUST00000101617 8939 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Dnajb12-203ENSMUST00000142819 1495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Timd4-201ENSMUST00000068877 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm26631-201ENSMUST00000181462 2505 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Nell2-202ENSMUST00000166170 3366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm37422-201ENSMUST00000193794 4718 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Kif2c-202ENSMUST00000106436 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Bpnt1-201ENSMUST00000027916 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Glb1l2-207ENSMUST00000162702 2555 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Got1l1-201ENSMUST00000038174 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Prkd2-201ENSMUST00000086104 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm18806-201ENSMUST00000207607 1775 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 6030466F02Rik-201ENSMUST00000212339 1434 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Pnkd-202ENSMUST00000087225 2859 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Cd55-201ENSMUST00000027650 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Borcs7-201ENSMUST00000074912 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Odf4-202ENSMUST00000125134 646 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm12907-201ENSMUST00000148027 507 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 1110038B12Rik-203ENSMUST00000173070 434 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Glmp-208ENSMUST00000176519 447 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Atp6v1g1-201ENSMUST00000035301 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 H1foo-201ENSMUST00000037831 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Tmem159-201ENSMUST00000033210 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Galntl6-202ENSMUST00000098757 2210 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Synpo-202ENSMUST00000115318 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm10652-201ENSMUST00000199790 2622 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Nr1i3-202ENSMUST00000075469 1305 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 CT010480.4-201ENSMUST00000224654 2283 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Myo7a-213ENSMUST00000205746 6689 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Slc19a1-209ENSMUST00000144234 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Mamld1-202ENSMUST00000114629 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm6580-201ENSMUST00000117504 1357 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 B430119L08Rik-201ENSMUST00000130054 1994 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Pacsin1-201ENSMUST00000045896 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Angel1-201ENSMUST00000021682 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 4931415C17Rik-202ENSMUST00000131064 2255 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Ccnt1-208ENSMUST00000169707 7397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Cobl-202ENSMUST00000109650 5271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Tle3-202ENSMUST00000159050 2304 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm14190-201ENSMUST00000105073 153 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Spg20-203ENSMUST00000117341 2957 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Prorsd1-202ENSMUST00000133103 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Trmt112-204ENSMUST00000174786 646 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 H2-Bl-202ENSMUST00000183560 316 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Gm5369-201ENSMUST00000217499 588 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Lect2-202ENSMUST00000225183 823 ntBASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Csnk2b-201ENSMUST00000025246 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Pkn3Q8K045 Surf6-201ENSMUST00000047632 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms