Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJC5

Neurl3, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurl3Q8CJC5 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Cend1-203ENSMUST00000137488 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Adgrv1-214ENSMUST00000224088 1492 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Dcaf11-203ENSMUST00000117701 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm15528-201ENSMUST00000117821 864 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm13937-201ENSMUST00000121000 988 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm16341-201ENSMUST00000126385 377 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm14662-201ENSMUST00000145552 734 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Zfp133-ps-204ENSMUST00000149523 424 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 H2-M2-202ENSMUST00000171139 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 7530416G11Rik-201ENSMUST00000178942 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Plac9a-202ENSMUST00000183431 536 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Plac9b-204ENSMUST00000184675 536 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm29067-201ENSMUST00000190821 470 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm43298-201ENSMUST00000200887 866 ntTSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Itgax-203ENSMUST00000205460 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 6430531B16Rik-204ENSMUST00000209335 898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Nutf2-202ENSMUST00000212042 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 AC159103.1-201ENSMUST00000228325 429 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tex10-206ENSMUST00000164866 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Bicra-201ENSMUST00000094821 5360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm10750-201ENSMUST00000099266 1506 ntAPPRIS P1 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 1700036A12Rik-202ENSMUST00000190053 1828 ntTSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 A130010J15Rik-204ENSMUST00000161235 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Wbp1l-204ENSMUST00000138302 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.26□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Ttc27-201ENSMUST00000024882 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Strc-201ENSMUST00000038389 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Sin3a-206ENSMUST00000168177 5086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Sox9-201ENSMUST00000000579 4135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 4933425D22Rik-201ENSMUST00000201035 1721 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Clcc1-202ENSMUST00000106609 2043 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm11892-201ENSMUST00000117711 1202 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm12208-201ENSMUST00000122004 163 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm11815-201ENSMUST00000139423 708 ntTSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Plgrkt-209ENSMUST00000152936 604 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tmem40-206ENSMUST00000170625 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm6408-201ENSMUST00000179032 1171 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm7271-202ENSMUST00000191515 836 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm2875-201ENSMUST00000211333 360 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 AC118476.3-201ENSMUST00000216419 1219 ntTSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 AC154257.1-202ENSMUST00000224729 843 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 AC134869.3-201ENSMUST00000225581 343 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Krtap6-2-201ENSMUST00000082065 786 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Ccl21a-201ENSMUST00000095114 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tepp-201ENSMUST00000098480 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Fhdc1-202ENSMUST00000107689 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tcim-201ENSMUST00000052622 1805 ntAPPRIS P1 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Dmrtc1b-203ENSMUST00000118842 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Foxh1-201ENSMUST00000037824 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm9244-201ENSMUST00000056767 2129 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Lef1-201ENSMUST00000029611 3482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Brsk2-216ENSMUST00000174499 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.25□□□□□ -0.77
Neurl3Q8CJC5 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms