Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHD8

Rab11fip3, Rab11 family-interacting protein 3, mousemouse

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Length 1,047 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab11fip3Q8CHD8 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm33366-201ENSMUST00000195583 3827 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Zfp112-204ENSMUST00000215113 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Med1-202ENSMUST00000092735 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nek1-208ENSMUST00000211256 4810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Plcb1-202ENSMUST00000110116 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Atl3-202ENSMUST00000170373 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mylip-202ENSMUST00000222178 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ubap2l-201ENSMUST00000029553 3509 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Vsir-202ENSMUST00000105459 1290 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cat-202ENSMUST00000111168 779 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm3-205ENSMUST00000115619 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm15507-201ENSMUST00000133523 592 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Mrip-ps-201ENSMUST00000184613 940 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43001-201ENSMUST00000198925 603 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm43671-201ENSMUST00000200422 433 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm45717-201ENSMUST00000211129 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Mok-203ENSMUST00000084974 1132 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Cenpu-202ENSMUST00000093518 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rapgef3-204ENSMUST00000128775 3586 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nr5a2-205ENSMUST00000192929 1756 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Platr19-201ENSMUST00000171380 1466 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gadl1-202ENSMUST00000119291 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tnfrsf13b-201ENSMUST00000010286 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Reln-207ENSMUST00000161356 11699 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Wif1-201ENSMUST00000020439 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Arfgap1-201ENSMUST00000029092 2714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Ccdc154-203ENSMUST00000182621 2402 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Mroh5-202ENSMUST00000110021 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Abi1-208ENSMUST00000139038 2899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Prkcg-201ENSMUST00000100301 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Palb2-204ENSMUST00000106469 2559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 4930430F08Rik-201ENSMUST00000054471 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Trpm2-201ENSMUST00000105399 731 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 C1qtnf7-202ENSMUST00000121872 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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Rab11fip3Q8CHD8 Gm45338-204ENSMUST00000210658 1105 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nme6-201ENSMUST00000035053 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Sapcd1-201ENSMUST00000040151 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Fam212a-201ENSMUST00000048568 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Tmem220-202ENSMUST00000079077 1147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm13306-201ENSMUST00000098122 418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Vat1l-201ENSMUST00000049509 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Arhgap19-204ENSMUST00000177495 1652 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rbm47-209ENSMUST00000201544 5211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Nfatc4-202ENSMUST00000172271 3775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Metap2-201ENSMUST00000047910 4424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Dclre1b-203ENSMUST00000106832 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Serpinb9c-202ENSMUST00000110284 1575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Gm6024-201ENSMUST00000117850 1558 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Armcx1-205ENSMUST00000113199 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Popdc2-202ENSMUST00000114739 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Foxk1-201ENSMUST00000072837 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Stat5b-202ENSMUST00000107358 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 D030045P18Rik-204ENSMUST00000215085 2186 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Paupar-201ENSMUST00000194826 3482 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Rab11fip3Q8CHD8 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
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