Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC6

Rbm28, RNA-binding protein 28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 750 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm28Q8CGC6 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ceacam12-203ENSMUST00000108487 1495 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cipc-208ENSMUST00000189246 1454 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Slc6a5-201ENSMUST00000056442 7065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Amotl2-211ENSMUST00000153965 4222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Olfr648-202ENSMUST00000216612 2929 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Nup62cl-201ENSMUST00000101212 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Pcgf3-201ENSMUST00000046975 7708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Sln-201ENSMUST00000048485 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Arhgef2-206ENSMUST00000175779 3065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Abi2-207ENSMUST00000188618 4723 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Vps25-205ENSMUST00000121331 790 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Igf1-205ENSMUST00000121952 798 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cideb-201ENSMUST00000001497 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm11753-201ENSMUST00000151091 396 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Rwdd2a-202ENSMUST00000179212 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 A430105J06Rik-201ENSMUST00000180869 1275 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gtf3c6-201ENSMUST00000019982 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Olfr1380-201ENSMUST00000204300 938 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Sdf2-201ENSMUST00000002133 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Myl6-211ENSMUST00000219236 692 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 CT573047.1-201ENSMUST00000223652 851 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gemin4-201ENSMUST00000102500 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Grpel1-201ENSMUST00000031099 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Pml-211ENSMUST00000153820 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Hdac6-202ENSMUST00000115642 4069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gid8-202ENSMUST00000078687 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cep76-201ENSMUST00000097542 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Pink1-202ENSMUST00000105816 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Mob3b-201ENSMUST00000102975 6030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Brd3-210ENSMUST00000164296 2791 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Prkcsh-202ENSMUST00000115331 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Ppnr-201ENSMUST00000190974 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Fbrs-207ENSMUST00000206394 2961 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Abcc10-202ENSMUST00000095261 5266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm37859-201ENSMUST00000195529 2173 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Hyal3-202ENSMUST00000148440 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Tgfbr1-201ENSMUST00000007757 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Nynrin-201ENSMUST00000100529 6990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gypa-201ENSMUST00000063359 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm6655-201ENSMUST00000201932 1309 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Fxyd5-212ENSMUST00000162733 2998 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Smc3-201ENSMUST00000025930 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm38089-201ENSMUST00000193585 1514 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Clic3-201ENSMUST00000102918 791 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rbm28Q8CGC6 Nop56-204ENSMUST00000136621 868 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
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Rbm28Q8CGC6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Trav13d-3-201ENSMUST00000179512 391 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Trav13n-3-201ENSMUST00000179580 337 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Cdipt-202ENSMUST00000205830 805 ntTSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm17825-201ENSMUST00000206836 794 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 AC136376.2-201ENSMUST00000228819 490 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm9873-201ENSMUST00000063891 1097 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm9962-201ENSMUST00000085241 321 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Otx2-202ENSMUST00000119070 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm4780-202ENSMUST00000215200 2644 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Rbm28Q8CGC6 Gm26811-201ENSMUST00000181258 5485 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 9430038I01Rik-203ENSMUST00000120340 4643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 9330111N05Rik-203ENSMUST00000181508 1848 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Cchcr1-205ENSMUST00000173903 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rbm28Q8CGC6 Fam120b-201ENSMUST00000055352 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
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