Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEI3

Ccdc28a, Coiled-coil domain-containing 28A, mousemouse

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Length 192 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc28aQ8CEI3 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dcaf4-201ENSMUST00000021645 2008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Zcwpw1-201ENSMUST00000035852 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a3-204ENSMUST00000225423 2589 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 C230014O12Rik-201ENSMUST00000134921 2668 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rpap2-204ENSMUST00000112654 2914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dnajb12-204ENSMUST00000146590 3070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43937-201ENSMUST00000204640 3122 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ppat-202ENSMUST00000140076 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Sema4d-201ENSMUST00000021900 4482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Nfe2l1-212ENSMUST00000169828 3530 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tlr12-201ENSMUST00000074829 3177 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pla2g16-202ENSMUST00000136465 3048 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Plin2-201ENSMUST00000000466 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm6831-202ENSMUST00000213025 1673 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Paqr8-203ENSMUST00000187651 1463 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Fpr1-201ENSMUST00000061516 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 D630003M21Rik-201ENSMUST00000046944 3910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Topors-201ENSMUST00000042575 3856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Hoxb5os-202ENSMUST00000150698 596 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20495-201ENSMUST00000173902 235 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm44066-201ENSMUST00000203263 519 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Lysmd4-208ENSMUST00000208698 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AC156501.1-201ENSMUST00000228219 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AC135114.1-201ENSMUST00000228682 270 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ndufb3-201ENSMUST00000027193 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc22d4-201ENSMUST00000031738 1043 ntTSL 3 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dnal4-202ENSMUST00000069877 1011 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm4978-201ENSMUST00000071565 801 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Myo15-203ENSMUST00000094135 11715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Dusp22-202ENSMUST00000095914 3015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gtf3c2-201ENSMUST00000088010 4552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Magee2-201ENSMUST00000033575 2316 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20498-203ENSMUST00000166664 2284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Prr30-202ENSMUST00000187304 2104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Capza1-201ENSMUST00000094028 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc28aQ8CEI3 4833411C07Rik-202ENSMUST00000207914 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc28aQ8CEI3 Tenm2-201ENSMUST00000057207 8298 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc28aQ8CEI3 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC11.97□□□□□ -0.49
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Ccdc28aQ8CEI3 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm45113-201ENSMUST00000207518 165 ntBASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pde5a-201ENSMUST00000066728 6939 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Slc9a8-202ENSMUST00000073873 4429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Slc10a3-203ENSMUST00000114146 1902 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Prkd2-202ENSMUST00000168093 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Psd3-213ENSMUST00000212505 3253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Syn2-202ENSMUST00000169345 3854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Gm20671-201ENSMUST00000144673 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Pik3cd-202ENSMUST00000105688 4335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Myh1-203ENSMUST00000124516 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.97□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Shoc2-201ENSMUST00000025932 4106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Olfr156-203ENSMUST00000214843 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Mdh1-201ENSMUST00000102874 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Zfp30-202ENSMUST00000122387 3342 ntTSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.96□□□□□ -0.49
Ccdc28aQ8CEI3 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC11.96□□□□□ -0.49
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