Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC0

Nup88, Nuclear pore complex protein Nup88, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 753 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup88Q8CEC0 Scgb1b19-201ENSMUST00000165813 418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Scgb1b3-201ENSMUST00000179481 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Pigc-201ENSMUST00000028021 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Olfr56-203ENSMUST00000179282 1935 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Nup88Q8CEC0 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Hs6st2-201ENSMUST00000088172 4318 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm14150-201ENSMUST00000122404 1354 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gsdmcl-ps-203ENSMUST00000188367 1375 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AC091458.1-201ENSMUST00000220902 1361 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Poldip3-201ENSMUST00000058793 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Abi1-203ENSMUST00000093171 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Scoc-202ENSMUST00000167525 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ddx56-201ENSMUST00000004507 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Folr1-203ENSMUST00000106983 1307 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Eno1-201ENSMUST00000080149 1902 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Irf9-205ENSMUST00000138037 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pnmal2-201ENSMUST00000094807 4147 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc6a9-210ENSMUST00000169885 1876 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm26714-201ENSMUST00000181338 1655 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rps2-ps4-201ENSMUST00000121977 633 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm13523-201ENSMUST00000151820 488 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm22144-201ENSMUST00000157402 102 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm15722-201ENSMUST00000159271 661 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm8365-201ENSMUST00000197334 648 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm43830-201ENSMUST00000198760 1067 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 4930448E22Rik-203ENSMUST00000215349 299 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm18974-201ENSMUST00000221478 1031 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm40576-201ENSMUST00000221773 1152 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Rdh16f2-201ENSMUST00000092058 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm10338-201ENSMUST00000096148 984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm4869-201ENSMUST00000197549 2955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 C030034L19Rik-203ENSMUST00000181930 3133 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Setdb1-202ENSMUST00000107170 4622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Hnrnph2-205ENSMUST00000113203 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm26684-202ENSMUST00000228229 8257 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Phkg2-201ENSMUST00000033086 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gabrr2-202ENSMUST00000108162 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Fubp1-209ENSMUST00000198227 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Thrap3-201ENSMUST00000080919 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm21998-201ENSMUST00000117552 1308 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 AC122291.1-201ENSMUST00000228937 5748 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Fbxo25-204ENSMUST00000209913 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Dph6-203ENSMUST00000102542 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Tcp11l2-201ENSMUST00000020223 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm20427-201ENSMUST00000168978 3703 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Arhgef15-203ENSMUST00000108671 4372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Ighv2-6-8-201ENSMUST00000103455 342 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm15004-201ENSMUST00000119192 630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Slc2a4rg-ps-202ENSMUST00000176590 1143 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm38228-201ENSMUST00000193169 1293 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Gm9463-201ENSMUST00000206707 601 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Pgam2-201ENSMUST00000020768 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 9530020I12Rik-203ENSMUST00000219371 819 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 CT010465.1-201ENSMUST00000222463 809 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Nup88Q8CEC0 Emp3-201ENSMUST00000038876 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
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