Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Insig2-214ENSMUST00000186915 674 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 5730585A16Rik-201ENSMUST00000193457 1027 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm33201-201ENSMUST00000204791 855 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm3285-201ENSMUST00000218443 908 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm19046-201ENSMUST00000221263 1298 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Mrps34-201ENSMUST00000043907 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Hdac7-205ENSMUST00000118294 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tmem215-201ENSMUST00000049655 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Wdr45-203ENSMUST00000115688 1510 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm13384-201ENSMUST00000117166 1344 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 AC154537.1-201ENSMUST00000226101 1304 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm43984-201ENSMUST00000204572 2864 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Flrt1-201ENSMUST00000113383 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Nol3-201ENSMUST00000014920 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Plrg1-202ENSMUST00000122128 1608 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Slc6a12-205ENSMUST00000166457 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Mier3-201ENSMUST00000047412 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Larp7-201ENSMUST00000029588 2121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Rsrc1-206ENSMUST00000162036 1406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 E330034L11Rik-201ENSMUST00000200640 1742 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Rbm47-204ENSMUST00000113726 4703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Zfp941-201ENSMUST00000080651 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm13422-201ENSMUST00000118834 504 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm15617-201ENSMUST00000118973 771 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm12516-201ENSMUST00000120819 385 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 n-R5s84-201ENSMUST00000122591 109 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Smim1-204ENSMUST00000130175 477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Smim1-206ENSMUST00000132541 490 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gad1-207ENSMUST00000148210 1021 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm14198-201ENSMUST00000153208 948 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm18159-201ENSMUST00000174516 1070 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Mrpl20-206ENSMUST00000185148 494 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm17877-201ENSMUST00000192578 814 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Hcst-203ENSMUST00000208740 366 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm36423-202ENSMUST00000222215 1298 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Cmbl-201ENSMUST00000070918 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Fli1-201ENSMUST00000016231 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Ncapd3-201ENSMUST00000073127 5499 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Ncoa3-202ENSMUST00000109252 5757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Rab3c-202ENSMUST00000223922 2398 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm8899-201ENSMUST00000214635 1332 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Stxbp5l-204ENSMUST00000114781 3544 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm17213-201ENSMUST00000165161 1360 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tnip1-202ENSMUST00000102730 2787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm43127-201ENSMUST00000195890 2789 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Anks1b-224ENSMUST00000182960 3397 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gabrr1-201ENSMUST00000029947 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm10604-201ENSMUST00000098260 1706 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Sypl2-201ENSMUST00000141387 4090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Vdr-201ENSMUST00000023119 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Zfp423-201ENSMUST00000052250 4510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Sstr3-201ENSMUST00000053239 3928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Brd4-202ENSMUST00000114475 2731 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Myh2-203ENSMUST00000170159 6083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tulp2-202ENSMUST00000085331 1525 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Rnf123-218ENSMUST00000178267 4309 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Btrc-209ENSMUST00000224478 2194 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Tie1-201ENSMUST00000047421 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Bdkrb2-201ENSMUST00000001652 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Ighv5-9-201ENSMUST00000103448 418 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms