Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXS2

Tnfsfm13, Tumor necrosis factor (ligand) superfamily, membrane-bound member 13, mousemouse

Predictions only

Length 410 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsfm13Q8BXS2 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Chrnb2-203ENSMUST00000200558 3482 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11525-201ENSMUST00000134436 2804 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5380-201ENSMUST00000119296 2136 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Cyp2c53-ps-203ENSMUST00000176493 1443 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5846-201ENSMUST00000193146 1414 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Fkbp15-204ENSMUST00000107461 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Lao1-201ENSMUST00000058651 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 2310043M15Rik-201ENSMUST00000180967 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 4931406C07Rik-201ENSMUST00000034414 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Fdxacb1-201ENSMUST00000042391 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 AC107453.4-201ENSMUST00000227068 1817 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Awat2-202ENSMUST00000147103 1984 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Rasgef1a-203ENSMUST00000203804 2183 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Ablim2-206ENSMUST00000114206 3528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpm1-221ENSMUST00000206706 2350 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Tnnt3-209ENSMUST00000105947 780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 4930578M07Rik-202ENSMUST00000212946 552 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr323-201ENSMUST00000070804 972 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
Tnfsfm13Q8BXS2 Akap5-203ENSMUST00000172992 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm35507-201ENSMUST00000197932 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Art2b-202ENSMUST00000209526 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Chit1-203ENSMUST00000160060 1580 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Sox13-203ENSMUST00000144386 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Astn1-211ENSMUST00000195311 3642 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nectin4-201ENSMUST00000006578 3636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Psd-201ENSMUST00000041391 3900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Psd-202ENSMUST00000096029 3903 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Lin52-201ENSMUST00000137170 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Spata2-201ENSMUST00000057627 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Brd3-201ENSMUST00000028282 5419 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ighv5-2-201ENSMUST00000103442 350 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Slc6a5-202ENSMUST00000107605 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ikbkg-205ENSMUST00000114129 2222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm11663-201ENSMUST00000117888 290 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tepp-204ENSMUST00000161029 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Nufip2-204ENSMUST00000181023 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mir6420-201ENSMUST00000185032 102 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Vmn1r205-201ENSMUST00000185475 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mob2-203ENSMUST00000209732 977 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Olfr239-202ENSMUST00000213731 3690 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpd1-201ENSMUST00000023760 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ccar2-201ENSMUST00000035612 3725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Entpd4-201ENSMUST00000064831 1842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gcnt7-201ENSMUST00000099060 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Jade1-201ENSMUST00000026865 5481 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Enpp4-201ENSMUST00000024757 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Ddx54-201ENSMUST00000031598 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tfr2-206ENSMUST00000198783 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Tmprss3-201ENSMUST00000024833 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Hcn1-201ENSMUST00000006991 14141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Tnfsfm13Q8BXS2 Klhl18-205ENSMUST00000198400 4638 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79 ms