Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF4

Ccdc30, Coiled-coil domain-containing protein 30, mousemouse

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Length 654 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc30Q8BVF4 Gm10731-201ENSMUST00000181171 448 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ccdc162-212ENSMUST00000219054 3182 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zfat-205ENSMUST00000162173 3561 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Crispld2-202ENSMUST00000108972 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tmem161a-201ENSMUST00000002413 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Cdc14a-201ENSMUST00000090464 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Vwa1-201ENSMUST00000042196 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Kifap3-201ENSMUST00000027877 3946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm9333-201ENSMUST00000205452 1323 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rab11fip2-202ENSMUST00000170819 1539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Plek2-201ENSMUST00000021544 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm14395-201ENSMUST00000120494 563 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm8737-201ENSMUST00000122208 642 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm20033-203ENSMUST00000180912 796 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm35549-201ENSMUST00000203176 735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 1700017B05Rik-202ENSMUST00000213199 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sorcs1-202ENSMUST00000111756 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sorcs1-207ENSMUST00000211008 3617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Qsox1-201ENSMUST00000035325 3348 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Fen1-202ENSMUST00000116542 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Fam107b-201ENSMUST00000027965 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm38140-201ENSMUST00000193617 2755 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Grm5-202ENSMUST00000125009 8047 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ino80c-203ENSMUST00000141489 2207 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm44153-201ENSMUST00000204162 1580 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Tmc7-201ENSMUST00000044195 4546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Scamp5-201ENSMUST00000046587 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Vgll4-201ENSMUST00000032459 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Hsh2d-201ENSMUST00000072097 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Ccdc30Q8BVF4 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm15764-201ENSMUST00000150389 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm11642-201ENSMUST00000150442 440 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rn7s1-201ENSMUST00000174924 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Rn7s2-201ENSMUST00000175032 300 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm26461-201ENSMUST00000175064 290 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm29088-201ENSMUST00000189363 581 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm37905-201ENSMUST00000195310 341 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm43916-201ENSMUST00000205062 967 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Bpifa1-201ENSMUST00000028985 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Mill2-201ENSMUST00000072386 1121 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gpcpd1-205ENSMUST00000110142 3703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Carmil1-201ENSMUST00000072889 4988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Atp1a3-201ENSMUST00000080882 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Hvcn1-202ENSMUST00000100747 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Ccdc30Q8BVF4 Gm14698-201ENSMUST00000096420 4226 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
Ccdc30Q8BVF4 Rcor3-202ENSMUST00000110849 3791 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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