Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGE6

Atg4b, Cysteine protease ATG4B, mousemouse

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Length 393 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg4bQ8BGE6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Otud7b-202ENSMUST00000090785 8101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc35a4-201ENSMUST00000036158 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ptgir-202ENSMUST00000144408 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ccl27a-203ENSMUST00000108033 428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tatdn3-203ENSMUST00000110891 1214 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tatdn3-204ENSMUST00000110893 1242 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tcf7l2-206ENSMUST00000111652 1041 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sap25-201ENSMUST00000166099 1101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 BC026585-203ENSMUST00000193791 778 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm43378-201ENSMUST00000199336 582 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm8579-201ENSMUST00000201943 733 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm13522-202ENSMUST00000209682 997 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Net1-206ENSMUST00000222504 447 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm28424-201ENSMUST00000187393 1319 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm45416-201ENSMUST00000209713 2201 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Trpm1-217ENSMUST00000206263 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Lgsn-201ENSMUST00000062560 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cd40-201ENSMUST00000017799 2986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Chl1-204ENSMUST00000203912 4628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rad23a-201ENSMUST00000003911 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15774-201ENSMUST00000141810 2176 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Actr1a-201ENSMUST00000040270 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Sec22b-201ENSMUST00000029476 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Slc19a1-201ENSMUST00000105410 2347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Clic4-201ENSMUST00000037099 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm13561-201ENSMUST00000136879 1826 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm10419-202ENSMUST00000196693 2530 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 4933408A14Rik-201ENSMUST00000199037 729 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
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Atg4bQ8BGE6 Gm4065-201ENSMUST00000218715 763 ntTSL 2 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 CT009546.1-201ENSMUST00000222573 1120 ntBASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr1350-201ENSMUST00000070985 927 ntAPPRIS P1 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Usp5-201ENSMUST00000047510 3213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 A930038B10Rik-202ENSMUST00000181044 3415 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pla2g4b-201ENSMUST00000126150 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm15622-201ENSMUST00000143025 1464 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Rnf44-217ENSMUST00000150806 3772 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Tcte1-201ENSMUST00000113547 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Cntd1-201ENSMUST00000103107 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm10432-202ENSMUST00000223300 4791 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Fbln2-201ENSMUST00000041544 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Car10-206ENSMUST00000107863 3334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Gm16083-201ENSMUST00000125681 2547 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Atp6v1d-201ENSMUST00000021536 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.72□□□□□ -0.69
Atg4bQ8BGE6 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.72□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.7 ms