Protein–RNA interactions for Protein: Q810L3

Chfr, E3 ubiquitin-protein ligase CHFR, mousemouse

Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChfrQ810L3 Cldn16-202ENSMUST00000161053 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Fam166b-206ENSMUST00000171134 1198 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm19459-201ENSMUST00000176240 835 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Crnde-207ENSMUST00000180102 732 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 4833445I07Rik-202ENSMUST00000194104 579 ntTSL 3 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Gm5714-201ENSMUST00000197343 566 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rbakdn-201ENSMUST00000198334 520 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Mcee-201ENSMUST00000037205 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Rin2-201ENSMUST00000094480 4657 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Tcof1-204ENSMUST00000176630 4529 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
ChfrQ810L3 Pip5k1a-206ENSMUST00000107236 3618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Wdcp-202ENSMUST00000085793 1992 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zfp235-201ENSMUST00000056549 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Rbm4b-201ENSMUST00000036744 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zmynd11-203ENSMUST00000110634 3824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Npy5r-203ENSMUST00000212563 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Sel1l-201ENSMUST00000021347 6300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm5859-201ENSMUST00000165401 2324 ntBASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Wt1os-203ENSMUST00000172701 2960 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 4930594M22Rik-202ENSMUST00000161599 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 C130050O18Rik-202ENSMUST00000163940 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ckmt1-201ENSMUST00000000317 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Spata13-210ENSMUST00000162945 5469 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Htr1b-202ENSMUST00000183482 4724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Xpnpep1-211ENSMUST00000183274 2120 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Map4-203ENSMUST00000163979 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Prx-201ENSMUST00000065487 4497 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Os9-202ENSMUST00000164259 2627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Taf9b-201ENSMUST00000055497 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Vps54-201ENSMUST00000006221 4323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zfp108-202ENSMUST00000205982 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Trak1-201ENSMUST00000045903 4827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Tspan14-202ENSMUST00000224209 2477 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Raph1-204ENSMUST00000140485 10024 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Vamp5-202ENSMUST00000101285 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Taf6l-202ENSMUST00000010249 848 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm14441-201ENSMUST00000121960 540 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm16036-201ENSMUST00000150385 1112 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Spaca6-209ENSMUST00000172097 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm29237-201ENSMUST00000186216 448 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm10774-201ENSMUST00000188689 204 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm44126-201ENSMUST00000204831 514 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm44867-201ENSMUST00000205675 530 ntTSL 3 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Il1f10-201ENSMUST00000058056 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ginm1-202ENSMUST00000065124 300 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Rpl35a-201ENSMUST00000078804 491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Angptl4-201ENSMUST00000002360 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 4933413J09Rik-202ENSMUST00000059648 3387 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Mmel1-202ENSMUST00000080559 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ubxn10-202ENSMUST00000105810 3304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ttc30a2-201ENSMUST00000099995 2431 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ccpg1-206ENSMUST00000140675 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Armc1-201ENSMUST00000029125 3673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Ranbp10-201ENSMUST00000041400 5308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Zfp280d-205ENSMUST00000183468 1834 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Pif1-203ENSMUST00000134538 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Mmp25-201ENSMUST00000024696 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Rgs8-201ENSMUST00000041776 8474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Sh3tc2-201ENSMUST00000051720 4536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Gpr155-203ENSMUST00000112043 3284 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
ChfrQ810L3 Olfr520-202ENSMUST00000220185 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.3 ms