Protein–RNA interactions for Protein: Q80XU8

Lrfn4, Leucine-rich repeat and fibronectin type-III domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrfn4Q80XU8 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Prrxl1-204ENSMUST00000189022 2985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gfra1-209ENSMUST00000169850 3224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm45677-201ENSMUST00000209975 1341 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Wdr33-201ENSMUST00000025264 6206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Pole-203ENSMUST00000112482 747 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Srrm3os-201ENSMUST00000131896 1271 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6397-201ENSMUST00000161973 1069 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm3150-201ENSMUST00000166418 204 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Park2-204ENSMUST00000179624 1108 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm26952-201ENSMUST00000181996 409 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 1700008K24Rik-201ENSMUST00000185974 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm4131-201ENSMUST00000186010 1264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Myl4-201ENSMUST00000018800 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm9540-201ENSMUST00000188230 478 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm44136-201ENSMUST00000203819 1106 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm6905-201ENSMUST00000205729 511 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm32850-202ENSMUST00000209149 732 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Immp1l-201ENSMUST00000037499 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Ly6g5c-201ENSMUST00000037849 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Krtap19-1-201ENSMUST00000081334 493 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Btbd9-202ENSMUST00000168787 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Tpd52l2-202ENSMUST00000069712 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Far2-201ENSMUST00000032443 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm10829-201ENSMUST00000202084 2988 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Gm38055-201ENSMUST00000195353 2217 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Stau2-206ENSMUST00000128957 3907 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 BC067074-203ENSMUST00000136755 8274 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Plcd4-206ENSMUST00000113750 2692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Lrfn4Q80XU8 Sp140-201ENSMUST00000080204 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Traf3ip3-201ENSMUST00000043550 2122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Ccdc97-201ENSMUST00000002683 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Bnc2-202ENSMUST00000107198 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Zmynd8-203ENSMUST00000099084 5232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Tanc1-201ENSMUST00000037526 7873 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Cttnbp2nl-201ENSMUST00000077548 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Zfp384-206ENSMUST00000112425 2691 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Celf1-204ENSMUST00000111448 4432 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 BC004004-201ENSMUST00000064709 2803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Fut4-201ENSMUST00000061498 4074 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Lrtm2-204ENSMUST00000168793 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm5795-201ENSMUST00000100920 984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Mir680-2-201ENSMUST00000102163 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm23251-201ENSMUST00000103773 110 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Map2k7-205ENSMUST00000110996 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 4931406G06Rik-201ENSMUST00000147848 1252 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm3685-201ENSMUST00000169215 984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Fut8-203ENSMUST00000177595 2980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gapdh-ps14-201ENSMUST00000183246 1002 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 4930422M22Rik-201ENSMUST00000191492 948 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm45909-201ENSMUST00000212413 1031 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Gm6653-201ENSMUST00000218063 1288 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
Lrfn4Q80XU8 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
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