Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPM1

Prrc2b, Protein PRRC2B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2bQ7TPM1 Gm19027-201ENSMUST00000187291 1355 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gfap-201ENSMUST00000067444 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mrc2-201ENSMUST00000021038 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cacna2d1-209ENSMUST00000199704 3861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Prrc2a-206ENSMUST00000174805 6741 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm42858-201ENSMUST00000202512 1704 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm2670-201ENSMUST00000180668 2804 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ptprm-203ENSMUST00000224091 3773 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Pgm3-201ENSMUST00000070064 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Fopnl-202ENSMUST00000120707 1414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Klhl6-201ENSMUST00000058839 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dmac2-202ENSMUST00000085953 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 2010315B03Rik-202ENSMUST00000177714 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ighv1-74-201ENSMUST00000103543 348 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm23439-201ENSMUST00000104292 132 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm26550-201ENSMUST00000180699 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm6644-201ENSMUST00000186507 951 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 1700085C21Rik-201ENSMUST00000187123 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm5254-201ENSMUST00000188353 977 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Platr10-202ENSMUST00000191479 818 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ndufc1-204ENSMUST00000193279 315 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm6677-201ENSMUST00000195100 441 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm33707-201ENSMUST00000195135 569 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tspan8-202ENSMUST00000080630 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cap2-202ENSMUST00000119341 2454 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Itga6-202ENSMUST00000112101 4156 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tmem168-201ENSMUST00000031554 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ptdss2-201ENSMUST00000026568 3624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ptp4a3-202ENSMUST00000163582 3808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm23604-201ENSMUST00000104311 132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Bglap3-203ENSMUST00000107543 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AU015836-201ENSMUST00000120624 674 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm13817-201ENSMUST00000142249 604 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm13869-201ENSMUST00000146978 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Milr1-206ENSMUST00000182896 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Milr1-207ENSMUST00000182908 811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Rab29-201ENSMUST00000027693 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Prg2-201ENSMUST00000028467 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm42913-201ENSMUST00000197936 1853 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Oprm1-222ENSMUST00000135502 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 B430203G13Rik-201ENSMUST00000169657 1375 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 4930579F01Rik-201ENSMUST00000012186 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Slc39a8-206ENSMUST00000180196 3383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC159810.1-201ENSMUST00000214838 1480 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Pik3r6-202ENSMUST00000102613 3225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Pik3r6-201ENSMUST00000060441 3237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm37160-201ENSMUST00000193081 1689 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm44755-201ENSMUST00000207830 2102 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Tekt2-202ENSMUST00000102616 1542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ncbp2-202ENSMUST00000115178 515 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Camk2a-204ENSMUST00000115295 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm24294-201ENSMUST00000158295 277 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm28671-201ENSMUST00000187036 692 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 1700084F23Rik-202ENSMUST00000188461 747 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 5830411K02Rik-201ENSMUST00000200000 997 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm32786-201ENSMUST00000211351 628 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Gm9736-201ENSMUST00000219969 834 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Ces3a-201ENSMUST00000093222 2046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 CT030159.3-201ENSMUST00000222936 1481 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Arhgap20-204ENSMUST00000130405 3881 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 Esrrb-203ENSMUST00000110204 4196 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Prrc2bQ7TPM1 AC155298.2-201ENSMUST00000225485 6226 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms