Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWS4

Cnih3, Protein cornichon homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnih3Q6ZWS4 Zfp606-202ENSMUST00000123589 3509 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cyp2b10-202ENSMUST00000072438 1916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Itga11-201ENSMUST00000034774 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tmem154-201ENSMUST00000107682 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gimap8-202ENSMUST00000203083 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Mapre2-203ENSMUST00000118826 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC154528.2-201ENSMUST00000228432 3023 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slco5a1-201ENSMUST00000115402 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Anks1b-233ENSMUST00000183156 4248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Fam47e-202ENSMUST00000131166 1500 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dnmt3a-218ENSMUST00000174817 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Eno3-201ENSMUST00000072841 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm45089-201ENSMUST00000208082 2040 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Nln-205ENSMUST00000224945 2486 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Osbpl7-206ENSMUST00000168565 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hmbox1-205ENSMUST00000176128 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 2010111I01Rik-201ENSMUST00000021911 2979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ank2-214ENSMUST00000182547 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Sh3d21-201ENSMUST00000094760 1859 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm31816-202ENSMUST00000209591 1332 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zeb2-203ENSMUST00000076836 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zfp174-201ENSMUST00000041778 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm25214-201ENSMUST00000104573 129 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Tspan4-202ENSMUST00000117634 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 B230206L02Rik-202ENSMUST00000132584 695 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm16686-201ENSMUST00000141816 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Syce3-202ENSMUST00000167959 480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC134869.4-202ENSMUST00000224350 837 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC121960.1-201ENSMUST00000227982 564 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Slc7a4-201ENSMUST00000063544 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm42641-202ENSMUST00000160217 4248 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arntl2-202ENSMUST00000111636 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arntl2-203ENSMUST00000111638 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Arntl2-201ENSMUST00000080530 1740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dcaf8-201ENSMUST00000074144 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Prom2-202ENSMUST00000103214 4190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cox17-202ENSMUST00000120495 3690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hyou1-206ENSMUST00000161318 4489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC167669.2-201ENSMUST00000224417 1620 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Capn8-201ENSMUST00000048941 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rtl1-201ENSMUST00000149046 6358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Hif1an-201ENSMUST00000040455 6194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Plscr1-202ENSMUST00000186364 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm1840-201ENSMUST00000051687 1432 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Oxsm-201ENSMUST00000022311 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 AC109214.1-201ENSMUST00000219520 1372 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Dhx38-201ENSMUST00000042601 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc130-202ENSMUST00000098578 2119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zscan12-203ENSMUST00000225545 4405 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Olfr370-203ENSMUST00000214156 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Zfp609-201ENSMUST00000159109 7777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Rfesd-201ENSMUST00000050997 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Nrp1-201ENSMUST00000026917 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Eef1akmt2-202ENSMUST00000120425 573 ntTSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Pisd-ps1-203ENSMUST00000145164 789 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Lypd1-203ENSMUST00000159529 989 ntTSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 H2afz-206ENSMUST00000173790 437 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm3764-203ENSMUST00000180635 1191 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm9230-201ENSMUST00000188228 532 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm28345-201ENSMUST00000188769 1139 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm28970-201ENSMUST00000191098 1139 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
Cnih3Q6ZWS4 Mllt11-204ENSMUST00000198948 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.42□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms