Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Olfr1419-202ENSMUST00000213954 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm22920-201ENSMUST00000102175 109 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gngt2-207ENSMUST00000107714 558 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm9062-201ENSMUST00000117712 727 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm24844-201ENSMUST00000158679 127 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm37835-201ENSMUST00000193305 361 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm43852-201ENSMUST00000202098 917 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Spcs1-203ENSMUST00000226374 592 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Abcg4-201ENSMUST00000034648 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pde4b-203ENSMUST00000097950 2756 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Grin1-208ENSMUST00000114318 3920 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Madd-208ENSMUST00000111370 5879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Madd-214ENSMUST00000111381 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Neu2-207ENSMUST00000172222 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm807-201ENSMUST00000181742 1723 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ccdc189-201ENSMUST00000072155 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc25a21-205ENSMUST00000217690 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc38a3-202ENSMUST00000167868 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cln3-201ENSMUST00000032962 2386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gpr146-203ENSMUST00000100514 4264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cd2bp2-207ENSMUST00000206026 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Fxr1-206ENSMUST00000198051 2127 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Zfp93-201ENSMUST00000032696 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ttll10-202ENSMUST00000051509 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc16a1-201ENSMUST00000046212 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm45576-201ENSMUST00000210981 1322 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Zfp189-202ENSMUST00000107696 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dglucy-202ENSMUST00000110069 3058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm20649-201ENSMUST00000160950 2740 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Egfr-202ENSMUST00000102884 2943 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm10681-202ENSMUST00000178221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Olfr541-203ENSMUST00000210357 1642 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tcirg1-204ENSMUST00000126070 3041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Csk-204ENSMUST00000215396 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Trmt2a-207ENSMUST00000140206 3520 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Zfp41-204ENSMUST00000161785 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm7666-201ENSMUST00000146631 819 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Lyzl4os-202ENSMUST00000156364 726 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 1700007P06Rik-201ENSMUST00000160380 823 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm16570-201ENSMUST00000161951 436 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm21976-204ENSMUST00000186911 528 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm35060-201ENSMUST00000207669 825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Mettl6-204ENSMUST00000227595 1027 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dntt-201ENSMUST00000051806 2128 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Fam189b-201ENSMUST00000041913 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tax1bp1-201ENSMUST00000080723 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Dsc2-201ENSMUST00000039247 4630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm18198-201ENSMUST00000204986 1551 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm4593-201ENSMUST00000205334 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Ces2d-ps-201ENSMUST00000043209 1656 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Slc9a3-203ENSMUST00000221703 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Axl-201ENSMUST00000002677 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Nt5dc2-206ENSMUST00000227794 1858 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Cnga4-202ENSMUST00000210344 1977 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Gm44573-201ENSMUST00000191753 2370 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Grin2b-205ENSMUST00000152012 2461 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Plg-201ENSMUST00000014578 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 4930431P19Rik-202ENSMUST00000207761 2959 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
RgmaQ6PCX7 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
RgmaQ6PCX7 AC167565.1-201ENSMUST00000226980 1833 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 110.5 ms