Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

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Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm5472-201ENSMUST00000178604 1678 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tfr2-201ENSMUST00000031729 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Etfbkmt-209ENSMUST00000179873 1576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tmem115-201ENSMUST00000010189 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tubd1-203ENSMUST00000108030 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Klk1b5-201ENSMUST00000074359 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Coasy-202ENSMUST00000107308 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Glb1l-201ENSMUST00000113623 2339 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Wfdc3-202ENSMUST00000109328 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Olfr874-201ENSMUST00000115004 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm11919-201ENSMUST00000117609 721 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm13426-201ENSMUST00000117887 795 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm12345-201ENSMUST00000119288 898 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 1700019D03Rik-207ENSMUST00000191441 638 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Gm26861-207ENSMUST00000223253 1095 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 AC154461.1-201ENSMUST00000224207 1005 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Fabp1-201ENSMUST00000067492 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Mrgpra1-201ENSMUST00000098438 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Nuak2-202ENSMUST00000082125 3107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ido1-202ENSMUST00000110667 1656 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Ms4a6b-201ENSMUST00000025580 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Pik3cd-201ENSMUST00000038859 4905 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Nrf1-201ENSMUST00000004761 1589 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Mtch2-202ENSMUST00000111467 2281 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ccdc18Q640L5 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Vtn-201ENSMUST00000017488 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm8968-201ENSMUST00000199133 1303 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Psmb3-201ENSMUST00000103147 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm13031-201ENSMUST00000140501 924 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Eif4e1b-210ENSMUST00000152204 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Dnajc4-202ENSMUST00000179118 840 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 A630075F10Rik-201ENSMUST00000180895 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm5122-202ENSMUST00000216854 1637 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
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Ccdc18Q640L5 Gm3527-201ENSMUST00000198905 460 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 AC125409.3-201ENSMUST00000223488 653 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm20554-201ENSMUST00000177421 2352 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm43102-201ENSMUST00000201004 2324 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cog1-201ENSMUST00000018805 3935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Slc25a25-201ENSMUST00000028160 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Heg1-205ENSMUST00000152782 8161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Cnot10-201ENSMUST00000070117 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 CT009757.3-201ENSMUST00000223367 2320 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Matr3-216ENSMUST00000190653 1846 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 E330021D16Rik-203ENSMUST00000204830 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Ccdc18Q640L5 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
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