Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Pip4k2c-201ENSMUST00000013970 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Igf2-201ENSMUST00000000033 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Best1-201ENSMUST00000117346 2080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ptprr-206ENSMUST00000148731 2511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Atxn7l1os2-201ENSMUST00000138617 2019 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 4921524J17Rik-201ENSMUST00000047749 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 4921513H07Rik-201ENSMUST00000201403 2238 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gps2-202ENSMUST00000072581 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Cct3-208ENSMUST00000168062 1943 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 1700037C06Rik-201ENSMUST00000132824 874 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Cdk5-203ENSMUST00000198990 783 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm45258-201ENSMUST00000210042 853 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm35850-202ENSMUST00000211705 2120 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Mrpl33-201ENSMUST00000031024 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tcl1b5-201ENSMUST00000000717 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Amigo3-201ENSMUST00000085060 2543 ntAPPRIS P1 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 5330413D20Rik-201ENSMUST00000208649 1416 ntTSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Dck-201ENSMUST00000031311 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Pik3cd-203ENSMUST00000105689 3132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Plac8-203ENSMUST00000112910 1224 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ube2d-ps-201ENSMUST00000121354 441 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm37782-201ENSMUST00000194879 678 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm10580-201ENSMUST00000097985 396 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm10582-201ENSMUST00000097987 396 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm10583-201ENSMUST00000097988 396 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 4933434E20Rik-206ENSMUST00000160640 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Wdr46-ps-201ENSMUST00000200591 1712 ntBASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Nnt-203ENSMUST00000109204 3198 ntTSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tspan9-202ENSMUST00000112171 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ccser2-202ENSMUST00000090024 7509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ehd3-201ENSMUST00000024860 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm16518-201ENSMUST00000117960 508 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Slfn5os-201ENSMUST00000127074 574 ntTSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Bnip2-208ENSMUST00000165389 945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Mipep-ps-201ENSMUST00000177439 291 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm7902-201ENSMUST00000198842 947 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 CT010480.2-201ENSMUST00000225424 737 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm15519-201ENSMUST00000120088 1566 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Cyp2d41-ps-201ENSMUST00000180453 1503 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Zbtb43-203ENSMUST00000113156 1828 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Slc6a4-201ENSMUST00000021195 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Vmn1r45-202ENSMUST00000226167 2893 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Trpc6-203ENSMUST00000217462 3168 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Rab3d-203ENSMUST00000122211 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 C5ar1-202ENSMUST00000168818 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Fggy-201ENSMUST00000043335 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Unk-202ENSMUST00000106452 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Mtap-201ENSMUST00000058030 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm8684-201ENSMUST00000195078 1564 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 7330404K18Rik-201ENSMUST00000125558 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm11634-201ENSMUST00000154147 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Plet1os-202ENSMUST00000190941 1119 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 P4htm-204ENSMUST00000193621 1297 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm34655-202ENSMUST00000215259 877 ntTSL 3 BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gpr137b-ps-202ENSMUST00000220647 1159 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Ackr3-201ENSMUST00000065587 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Foxd2os-201ENSMUST00000123272 2908 ntTSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Clec12b-201ENSMUST00000032261 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
PatjQ63ZW7 Tgm2-201ENSMUST00000103122 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.41□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.7 ms