Protein–RNA interactions for Protein: Q61687

Atrx, Transcriptional regulator ATRX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,476 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrxQ61687 AC155709.2-201ENSMUST00000219360 678 ntTSL 3 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Olfr669-201ENSMUST00000098164 954 ntAPPRIS P1 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Col15a1-203ENSMUST00000107730 1755 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Hlf-201ENSMUST00000004051 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Unc45a-201ENSMUST00000032748 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Herc3-201ENSMUST00000031823 3596 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 2700068H02Rik-201ENSMUST00000137882 1872 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Slc1a4-201ENSMUST00000004634 3872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Megf11-203ENSMUST00000118485 3944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Zfp704-201ENSMUST00000041124 13834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Nupl1-206ENSMUST00000225111 2936 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Cic-212ENSMUST00000169266 8221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Dcaf12l1-202ENSMUST00000115056 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Dnmt3l-ps1-201ENSMUST00000118734 1253 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Cdpf1-205ENSMUST00000150995 566 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Tnnt1-201ENSMUST00000071798 1027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Sectm1b-202ENSMUST00000081499 1222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Gm10263-201ENSMUST00000085163 300 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Setd3-202ENSMUST00000109879 2387 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Sgk3-201ENSMUST00000097826 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Slc8b1-204ENSMUST00000111890 2775 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.74
AtrxQ61687 Spert-203ENSMUST00000165569 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Sema5b-201ENSMUST00000050625 4350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Atp5g3-202ENSMUST00000111996 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm5270-201ENSMUST00000121506 1002 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm13783-201ENSMUST00000131634 732 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Pttg1ip-208ENSMUST00000162943 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm17709-201ENSMUST00000174536 1096 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Tmprss11c-202ENSMUST00000196462 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm43966-201ENSMUST00000203301 612 ntBASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Hsf2-204ENSMUST00000220042 2430 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Zeb2-211ENSMUST00000153561 2070 ntTSL 1 (best) BASIC10.4□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Scarf1-201ENSMUST00000042808 2887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Rit2-203ENSMUST00000153060 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 1700025G04Rik-201ENSMUST00000044581 9559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 P2ry1-201ENSMUST00000029331 3886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Ttyh1-202ENSMUST00000079415 2882 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Arvcf-202ENSMUST00000115610 3829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Fads6-201ENSMUST00000056153 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Fam53b-201ENSMUST00000065371 5052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Il34-201ENSMUST00000076846 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Dct-201ENSMUST00000022725 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Capns1-202ENSMUST00000108196 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Fmr1nb-203ENSMUST00000114647 679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Rpl10-ps6-201ENSMUST00000121321 642 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm26313-201ENSMUST00000157770 308 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm7765-201ENSMUST00000182585 974 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Rpl10-ps5-201ENSMUST00000212707 642 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm3379-201ENSMUST00000222259 642 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 CT010506.1-201ENSMUST00000223673 349 ntBASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Bcl7a-201ENSMUST00000031391 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Alg12-204ENSMUST00000162183 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Pex2-206ENSMUST00000195855 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
AtrxQ61687 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.39□□□□□ -0.75
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