Protein–RNA interactions for Protein: Q61602

Gli3, Transcriptional activator GLI3, mousemouse

Predictions only

Length 1,583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli3Q61602 Apela-201ENSMUST00000124790 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Elof1-201ENSMUST00000013966 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm16322-202ENSMUST00000141275 700 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Scgb1b21-201ENSMUST00000170232 268 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm5627-201ENSMUST00000178539 931 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 1700065O20Rik-201ENSMUST00000186872 710 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 AC116589.8-201ENSMUST00000220945 364 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gzmf-201ENSMUST00000022757 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Elfn1-201ENSMUST00000050519 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Kcnk2-209ENSMUST00000194402 1373 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Dcstamp-205ENSMUST00000228556 1684 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Rab27b-201ENSMUST00000069749 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Agbl4-202ENSMUST00000097920 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Prkcd-204ENSMUST00000112206 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm3880-201ENSMUST00000122154 337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm12688-201ENSMUST00000136525 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm16268-201ENSMUST00000159445 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Malat1-205ENSMUST00000174808 656 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm23521-201ENSMUST00000177845 110 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Ighv6-4-201ENSMUST00000177949 297 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Gli3Q61602 Olfr1415-203ENSMUST00000204766 403 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Olfr139-203ENSMUST00000206280 1059 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Pla2g2a-201ENSMUST00000077582 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Drc1-201ENSMUST00000101448 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm29100-201ENSMUST00000187564 4410 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Gli3Q61602 Gm6721-201ENSMUST00000218353 1445 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Anxa9-202ENSMUST00000107183 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Slc29a1-204ENSMUST00000163492 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 H2-M2-201ENSMUST00000016427 1550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Eif2b3-201ENSMUST00000070610 1369 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm11929-201ENSMUST00000118175 945 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 6330418K02Rik-202ENSMUST00000125662 1267 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm15208-201ENSMUST00000134448 493 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 4930448D08Rik-201ENSMUST00000149958 1247 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm23999-201ENSMUST00000158057 104 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 H2-Pb-201ENSMUST00000172731 531 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm40414-201ENSMUST00000197608 481 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm42617-201ENSMUST00000197640 1229 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 AC153379.1-201ENSMUST00000218174 485 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gli3Q61602 Polr2k-201ENSMUST00000057177 601 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gli3Q61602 Cct2-201ENSMUST00000047672 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gli3Q61602 Diaph1-202ENSMUST00000080033 4378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Gli3Q61602 Ildr1-202ENSMUST00000089618 2850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Prdx2-202ENSMUST00000109733 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Cd247-205ENSMUST00000161559 1816 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm7001-201ENSMUST00000219384 1465 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Zmym1-202ENSMUST00000106099 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm12362-201ENSMUST00000121986 342 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Eif4a-ps4-201ENSMUST00000122226 1218 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm15888-201ENSMUST00000154016 538 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm26931-201ENSMUST00000182273 609 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Pcdh7-207ENSMUST00000199310 659 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm20186-203ENSMUST00000202542 741 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 4933439N14Rik-201ENSMUST00000211062 1087 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm31763-201ENSMUST00000217788 673 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm6129-201ENSMUST00000220725 801 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm16410-201ENSMUST00000094550 774 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Prpf18-204ENSMUST00000152362 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Eng-202ENSMUST00000113272 3021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Selenot-201ENSMUST00000107924 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Gm19951-201ENSMUST00000222616 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Caln1-202ENSMUST00000111287 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Gli3Q61602 Cars-201ENSMUST00000010899 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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