Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm8146-201ENSMUST00000192106 1847 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Psmc3-201ENSMUST00000002171 1819 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Wdcp-201ENSMUST00000053034 2892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 E130018N17Rik-201ENSMUST00000129713 1309 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Xkr6-202ENSMUST00000120820 1702 ntTSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Mmel1-203ENSMUST00000105634 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Alas2-202ENSMUST00000112715 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 1700019D03Rik-201ENSMUST00000050567 3641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Car12-202ENSMUST00000085420 3639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.32□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tor4a-201ENSMUST00000081869 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 9530082P21Rik-203ENSMUST00000181605 3162 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Oprm1-212ENSMUST00000105603 2053 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ets2-201ENSMUST00000023612 3890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm45199-201ENSMUST00000207640 1507 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rai2-201ENSMUST00000061514 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 G630016G05Rik-202ENSMUST00000156095 3398 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ppil6-201ENSMUST00000105507 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Myl2-203ENSMUST00000111751 889 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gsg1-202ENSMUST00000111909 1087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm11960-201ENSMUST00000122068 925 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm11587-201ENSMUST00000128274 1120 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tmem40-205ENSMUST00000166254 811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm28375-201ENSMUST00000185304 430 ntTSL 3 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm29087-201ENSMUST00000186462 645 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rps12-208ENSMUST00000220070 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Psmg2-201ENSMUST00000025418 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Olfr311-201ENSMUST00000071625 927 ntAPPRIS P1 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Immt-202ENSMUST00000101301 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Abhd4-201ENSMUST00000041197 2401 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Atp8a1-202ENSMUST00000072971 7154 ntTSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 H2-T24-201ENSMUST00000113760 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm43773-201ENSMUST00000198548 2162 ntBASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Spats2l-211ENSMUST00000169772 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Pla2g4c-201ENSMUST00000043612 3382 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 1110059E24Rik-201ENSMUST00000038830 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Siglech-206ENSMUST00000171077 1934 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Rxfp2-201ENSMUST00000065745 2539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Slc39a14-202ENSMUST00000068044 4926 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.31□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Sparc-202ENSMUST00000108858 2115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Adgrl3-214ENSMUST00000120445 5230 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Frmd8-201ENSMUST00000025728 4504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Metap2-208ENSMUST00000181091 1876 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ptprh-202ENSMUST00000166650 3642 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Usp11-201ENSMUST00000033383 3467 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Prpf8-201ENSMUST00000018449 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 C2cd5-203ENSMUST00000171349 4292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Man2b2-201ENSMUST00000031002 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Cdadc1-203ENSMUST00000167100 2243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Krtap4-8-201ENSMUST00000107439 983 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm12165-201ENSMUST00000117047 342 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 1810020O05Rik-201ENSMUST00000162547 1047 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fundc1-204ENSMUST00000176638 448 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm9866-204ENSMUST00000183238 351 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Mir8093-201ENSMUST00000185043 137 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm29499-201ENSMUST00000189151 486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm28329-201ENSMUST00000191208 689 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm29171-201ENSMUST00000191397 486 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm38314-201ENSMUST00000195709 625 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm5982-201ENSMUST00000196234 512 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm6108-201ENSMUST00000208365 367 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Tagln3-201ENSMUST00000096057 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Fam114a2-201ENSMUST00000020831 2557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Atxn2l-203ENSMUST00000167759 4023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Gm43242-201ENSMUST00000199507 1776 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 A830018L16Rik-202ENSMUST00000135014 6451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Mtr-201ENSMUST00000099856 8294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Inpp4a-208ENSMUST00000137266 2934 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
JrkQ60976 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms