Protein–RNA interactions for Protein: Q5XPI3

Rnf123, E3 ubiquitin-protein ligase RNF123, mousemouse

Predictions only

Length 1,314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf123Q5XPI3 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Mybph-202ENSMUST00000191577 2320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Aars2-201ENSMUST00000024733 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm15674-201ENSMUST00000143266 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Zfp354c-202ENSMUST00000109135 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Radil-203ENSMUST00000110784 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Mzf1-201ENSMUST00000069289 3597 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm8378-202ENSMUST00000167777 2624 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm11675-201ENSMUST00000121873 832 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm16195-201ENSMUST00000130607 442 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Rdh9-203ENSMUST00000136223 1276 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 C230038L03Rik-202ENSMUST00000136294 1197 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 4930538E20Rik-202ENSMUST00000146717 497 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 C730034F03Rik-201ENSMUST00000168646 1280 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm26838-201ENSMUST00000180485 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm10550-201ENSMUST00000188846 982 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Creb1-209ENSMUST00000190348 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Cldnd2-202ENSMUST00000206839 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm40983-201ENSMUST00000222524 502 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Ngdn-201ENSMUST00000022815 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Pgpep1l-201ENSMUST00000032770 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Pbp2-201ENSMUST00000050471 1279 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm5965-201ENSMUST00000009191 588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Fam177a-201ENSMUST00000177768 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm28774-201ENSMUST00000187087 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Nrf1-220ENSMUST00000170535 1527 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm18262-201ENSMUST00000222560 1946 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Mfsd4b5-202ENSMUST00000073618 2978 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 U2af1l4-237ENSMUST00000167042 3007 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Lnx1-203ENSMUST00000113531 3098 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm45041-201ENSMUST00000207366 3108 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Myh13-202ENSMUST00000108684 6062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Extl3-203ENSMUST00000225633 6013 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Fzd6-201ENSMUST00000022906 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Brat1-201ENSMUST00000041588 3333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Lcorl-205ENSMUST00000121573 2378 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Bdp1-201ENSMUST00000038104 9921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Azin1-203ENSMUST00000110329 4217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Atp6v1e1-201ENSMUST00000019354 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Cela3b-201ENSMUST00000102522 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Mrpl20-202ENSMUST00000130188 442 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 4930506C21Rik-203ENSMUST00000130639 909 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Itpr3os-201ENSMUST00000143605 794 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Taf9-201ENSMUST00000167256 1230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm19246-201ENSMUST00000173599 255 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Spdye4c-203ENSMUST00000178601 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Mir7686-201ENSMUST00000200604 57 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Crcp-204ENSMUST00000202163 931 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 4930430O22Rik-202ENSMUST00000202548 579 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm9132-201ENSMUST00000210182 832 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm10318-202ENSMUST00000217996 639 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm40652-201ENSMUST00000218944 895 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 AC136986.1-201ENSMUST00000222829 380 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm6781-201ENSMUST00000038304 1242 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Hist1h1b-201ENSMUST00000080511 743 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Tyw1-201ENSMUST00000040213 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Gm45650-201ENSMUST00000211162 2169 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Unkl-201ENSMUST00000015271 3414 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Usp17le-202ENSMUST00000211384 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Rnf123Q5XPI3 Abca3-201ENSMUST00000039013 6476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
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