Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Pgf-201ENSMUST00000004913 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Atxn7l3-203ENSMUST00000107134 3712 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Loxl4-201ENSMUST00000026190 3738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 BC004004-203ENSMUST00000149405 1402 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mtmr7-205ENSMUST00000174205 2679 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 C1qtnf3-201ENSMUST00000022853 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zdhhc21-201ENSMUST00000030110 8763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pcdhga1-201ENSMUST00000194190 4692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dysf-211ENSMUST00000168387 6501 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 4932443L11Rik-201ENSMUST00000148353 414 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm4271-201ENSMUST00000174444 973 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Caly-203ENSMUST00000211044 1029 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ppcdc-207ENSMUST00000214339 738 ntTSL 2 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb1-201ENSMUST00000020101 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ubash3a-201ENSMUST00000048656 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Thsd7a-206ENSMUST00000172356 10998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dopey2-201ENSMUST00000045004 7319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mamdc2-201ENSMUST00000036069 3338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pklr-201ENSMUST00000047111 2787 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ctnnd1-223ENSMUST00000111697 5294 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rassf2-201ENSMUST00000028814 8233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Prkcd-208ENSMUST00000112211 2851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC9.25□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm28138-201ENSMUST00000186250 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm29270-201ENSMUST00000188071 2167 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm29392-201ENSMUST00000189429 2167 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm29252-201ENSMUST00000189869 2167 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm29305-201ENSMUST00000191054 2167 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Elmo3-201ENSMUST00000109375 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Lztr1-202ENSMUST00000115681 3394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Pop1-201ENSMUST00000052290 3395 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rcbtb2-223ENSMUST00000170677 3573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Osmr-201ENSMUST00000022746 5491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Phyh-201ENSMUST00000027975 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cage1-201ENSMUST00000074969 2856 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Magt1-204ENSMUST00000151689 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 P2ry14-206ENSMUST00000197841 2476 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Mpv17-202ENSMUST00000200744 1653 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm40557-201ENSMUST00000220782 2736 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Tiam2-202ENSMUST00000169838 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Drap1-210ENSMUST00000148219 727 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ccdc103-202ENSMUST00000159834 1156 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 2010310C07Rik-202ENSMUST00000190889 842 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm18893-201ENSMUST00000198416 943 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm18584-201ENSMUST00000203098 964 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Aprt-209ENSMUST00000213062 560 ntTSL 2 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm19994-201ENSMUST00000217086 586 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp944-201ENSMUST00000115535 2784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Sft2d1Q5SSN7 Cacna2d1-204ENSMUST00000115281 3412 ntTSL 1 (best) BASIC9.24□□□□□ -0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.3 ms