Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

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Length 145 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Dio2-201ENSMUST00000082432 5815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm2464-201ENSMUST00000180838 2551 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm13689-201ENSMUST00000119360 685 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm13315-201ENSMUST00000120376 991 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm26185-201ENSMUST00000157692 266 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Olfr455-201ENSMUST00000171307 954 ntAPPRIS P1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm42929-201ENSMUST00000198374 1286 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm36355-201ENSMUST00000203752 639 ntTSL 3 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AC148334.1-201ENSMUST00000220853 370 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Sun1-204ENSMUST00000110882 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 March10-201ENSMUST00000049995 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Casq2-205ENSMUST00000165540 2434 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp451-202ENSMUST00000044455 11876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cdh23-203ENSMUST00000105462 10592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ilf3-201ENSMUST00000067646 3549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Lrrc61-202ENSMUST00000114545 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ppil2-201ENSMUST00000023455 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Pold1-201ENSMUST00000049343 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Zmat2-201ENSMUST00000001419 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Hmgb1-201ENSMUST00000085546 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Myadm-201ENSMUST00000096744 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Eno2-201ENSMUST00000004378 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Fndc8-201ENSMUST00000018988 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Pou2f1-204ENSMUST00000111426 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm37131-201ENSMUST00000192502 1561 ntBASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ccndbp1-201ENSMUST00000060455 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 D430042O09Rik-203ENSMUST00000124223 5874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Tyw3-204ENSMUST00000170461 4270 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Txnrd1-201ENSMUST00000020484 3325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Htr2c-201ENSMUST00000036303 4747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rad51ap1-202ENSMUST00000112221 1871 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm32219-201ENSMUST00000221234 1819 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 BC024978-201ENSMUST00000108379 7247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gabra5-203ENSMUST00000206734 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm26541-201ENSMUST00000181866 3973 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Trappc1Q5NCF2 Gdf2-201ENSMUST00000100720 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm37042-201ENSMUST00000193816 581 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
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Trappc1Q5NCF2 AC102569.1-201ENSMUST00000221563 685 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Dkkl1-201ENSMUST00000033057 1149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Myl3-201ENSMUST00000079784 937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Lgals1-201ENSMUST00000089377 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm9220-201ENSMUST00000190721 2544 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Adgrl2-217ENSMUST00000200154 5412 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 L3mbtl3-201ENSMUST00000040219 4572 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Tex13c1-201ENSMUST00000105113 2074 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Txndc16-203ENSMUST00000123879 4069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Oprm1-213ENSMUST00000105604 1616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Acad10-202ENSMUST00000111770 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 AC108416.1-201ENSMUST00000228755 1558 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Atp5g1-201ENSMUST00000090541 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Scn2b-202ENSMUST00000170998 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 CT009601.1-201ENSMUST00000225567 2705 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gys1-206ENSMUST00000211150 2681 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Nup188-201ENSMUST00000064447 5710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Rassf2-202ENSMUST00000103182 4589 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Acy1-201ENSMUST00000024031 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Cilp-201ENSMUST00000048762 4153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm8271-201ENSMUST00000171053 1469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Gm26865-201ENSMUST00000180970 3284 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Sema3e-201ENSMUST00000073957 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Grpr-201ENSMUST00000033730 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Trappc1Q5NCF2 Itgam-201ENSMUST00000064821 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms