Protein–RNA interactions for Protein: Q4VAA7

Snx33, Sorting nexin-33, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx33Q4VAA7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 8430408G22Rik-201ENSMUST00000067354 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Prox1os-201ENSMUST00000110279 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm15808-201ENSMUST00000119046 604 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm12749-201ENSMUST00000122138 1159 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Pcbd2-202ENSMUST00000124968 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 H2al1g-201ENSMUST00000179859 509 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm4857-201ENSMUST00000192718 785 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 AA914427-201ENSMUST00000193194 1166 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm38117-201ENSMUST00000194653 939 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm9678-201ENSMUST00000198979 1149 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Zfp706-203ENSMUST00000226453 517 ntAPPRIS P1 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 AC093022.1-201ENSMUST00000226949 1072 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Tmem258-201ENSMUST00000040372 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Nme1-203ENSMUST00000135884 3181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm37580-201ENSMUST00000192408 2800 ntBASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rgs12-203ENSMUST00000114280 2777 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Stx1b-201ENSMUST00000106267 4536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Igsf1-204ENSMUST00000114893 2671 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Tsc2-201ENSMUST00000097373 6018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Coq8a-201ENSMUST00000027766 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Elavl2-204ENSMUST00000107110 3671 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rxrg-201ENSMUST00000015987 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Mirg-201ENSMUST00000181496 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.45□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Chil1-207ENSMUST00000153856 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm7642-201ENSMUST00000216345 1809 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm19178-201ENSMUST00000217524 1819 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Nos3-201ENSMUST00000030834 4132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Platr25-207ENSMUST00000222477 1705 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Treml4-201ENSMUST00000059873 1744 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Prss57-203ENSMUST00000169684 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Sdccag8-201ENSMUST00000027785 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Spock2-203ENSMUST00000165024 3699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Supt16-201ENSMUST00000046709 4673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Clec10a-201ENSMUST00000000327 1454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Vamp1-202ENSMUST00000063588 1400 ntTSL 2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Fut10-202ENSMUST00000110527 2327 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Igf1-207ENSMUST00000122386 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Flad1-202ENSMUST00000107426 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rps9-202ENSMUST00000108623 1347 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Atp6v1a-201ENSMUST00000063661 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ccdc28b-202ENSMUST00000106035 821 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm14071-201ENSMUST00000117817 509 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rap1a-ps2-201ENSMUST00000118467 559 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm3329-201ENSMUST00000159873 556 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Slc6a9-209ENSMUST00000163288 2107 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ly6g6c-201ENSMUST00000173207 598 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ly6g6c-202ENSMUST00000173478 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm8856-201ENSMUST00000185254 1144 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
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Snx33Q4VAA7 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Treml1-205ENSMUST00000225849 974 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Madd-206ENSMUST00000099725 5905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Enox1-203ENSMUST00000227662 3064 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 B3galt5-201ENSMUST00000099497 5147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Cd300lg-201ENSMUST00000017453 2353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 6030443J06Rik-201ENSMUST00000181209 2380 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Fam118b-202ENSMUST00000063782 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Prss43-201ENSMUST00000077549 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rbm47-205ENSMUST00000167950 4895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Pdzk1-202ENSMUST00000107069 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ccm2-202ENSMUST00000109721 1551 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Steap3-203ENSMUST00000112641 5158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Arhgef9-201ENSMUST00000113873 2117 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Nme8-202ENSMUST00000091763 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Hap1-202ENSMUST00000138603 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ehd2-201ENSMUST00000098799 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 9030624J02Rik-202ENSMUST00000059390 5097 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm43908-201ENSMUST00000205074 1472 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Wwp2-201ENSMUST00000166615 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Madd-213ENSMUST00000111376 5927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm20696-201ENSMUST00000155466 3560 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Rasgrp4-210ENSMUST00000203070 3008 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Slc2a10-201ENSMUST00000029196 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Exoc4-203ENSMUST00000115080 2369 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Gm20755-201ENSMUST00000196893 1827 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
Snx33Q4VAA7 Ppip5k1-205ENSMUST00000110628 5404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms