Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Cldn19-202ENSMUST00000094823 4168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm14644-201ENSMUST00000116671 647 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13061-201ENSMUST00000137962 664 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ikzf2-202ENSMUST00000187184 2013 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pomt1-201ENSMUST00000036473 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccdc70-202ENSMUST00000070649 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb2-208ENSMUST00000187089 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Myh4-201ENSMUST00000018632 6016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gsdmc2-202ENSMUST00000188404 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm43597-202ENSMUST00000201992 4620 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Btnl4-201ENSMUST00000065841 1761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Slc38a3-209ENSMUST00000193932 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Chst15-202ENSMUST00000080215 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a21-201ENSMUST00000085364 1732 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Calu-201ENSMUST00000031779 3229 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37122-201ENSMUST00000195313 1567 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gtf3c6-206ENSMUST00000217537 2526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rnf6-206ENSMUST00000161859 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Atad5-201ENSMUST00000017694 7272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13556-201ENSMUST00000132692 1412 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf5-202ENSMUST00000163511 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfsf13b-203ENSMUST00000207792 4771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Snrnp27-202ENSMUST00000113683 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rpl39-201ENSMUST00000115231 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 1700030M09Rik-202ENSMUST00000181679 964 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Pxdn-208ENSMUST00000220271 6377 ntTSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
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D13Ertd608eQ3UPR8 Vezt-202ENSMUST00000118077 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Chmp1b-202ENSMUST00000210564 2490 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Exoc7-202ENSMUST00000106411 3205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnip1-206ENSMUST00000108889 2834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf2-206ENSMUST00000163748 2656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbrs-201ENSMUST00000048896 2650 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm39168-201ENSMUST00000210181 1423 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Atf7ip2-201ENSMUST00000044005 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ttc8-201ENSMUST00000079146 2270 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pigo-202ENSMUST00000098109 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Actl7a-201ENSMUST00000095079 1513 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Hpcal4-201ENSMUST00000059667 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Rhox5-201ENSMUST00000179626 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmgcll1-207ENSMUST00000183979 1136 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Caly-204ENSMUST00000211283 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Gzmn-202ENSMUST00000225535 989 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndufb4-201ENSMUST00000023514 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
D13Ertd608eQ3UPR8 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
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