Protein–RNA interactions for Protein: Q3UN04

Usp30, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 30, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp30Q3UN04 Apbb2-216ENSMUST00000162366 6540 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 AC165351.1-201ENSMUST00000219078 2020 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Axl-202ENSMUST00000085948 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Asb13-201ENSMUST00000042288 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Sstr2-203ENSMUST00000146390 2143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Sparcl1-201ENSMUST00000031249 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Cdh18-204ENSMUST00000165614 2162 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Ush1c-206ENSMUST00000154292 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Acoxl-201ENSMUST00000028859 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Rnf223-201ENSMUST00000209248 2908 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Rffl-205ENSMUST00000103218 1264 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm25148-201ENSMUST00000104611 123 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Ywhaq-ps2-201ENSMUST00000117738 643 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Klra4-201ENSMUST00000119096 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm9673-201ENSMUST00000119287 781 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Dnmt3l-203ENSMUST00000131825 1113 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Dnmt3l-206ENSMUST00000139539 1279 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm28038-201ENSMUST00000143119 378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 2810403D21Rik-208ENSMUST00000153212 1005 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm24679-201ENSMUST00000158762 111 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm16553-201ENSMUST00000160490 716 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Dydc1-202ENSMUST00000161837 829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Taar8c-201ENSMUST00000170267 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 2610316D01Rik-201ENSMUST00000181047 924 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm37013-201ENSMUST00000194544 313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm43365-201ENSMUST00000196522 2106 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm25053-202ENSMUST00000199731 132 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Mt1-202ENSMUST00000211807 1085 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 AC122891.1-201ENSMUST00000218671 268 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Pbld1-206ENSMUST00000219687 788 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm9508-201ENSMUST00000220084 693 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 CT030653.1-201ENSMUST00000224382 1279 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Taar8a-201ENSMUST00000051133 1035 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Plekha6-203ENSMUST00000186917 4820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gprc5d-202ENSMUST00000111922 1317 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Capzb-201ENSMUST00000030518 1390 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Oprm1-203ENSMUST00000056385 1440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Fgd5-202ENSMUST00000113466 5621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Lipe-201ENSMUST00000003207 3613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Epha5-205ENSMUST00000113403 4675 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm13404-201ENSMUST00000156633 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Trak1-213ENSMUST00000211439 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Tmem200a-203ENSMUST00000218232 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Mroh1-201ENSMUST00000092595 5111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Svopl-202ENSMUST00000096040 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Atad2-201ENSMUST00000038194 5684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Hist1h2be-201ENSMUST00000051091 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Dync1i2-208ENSMUST00000112144 2565 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 1110046J04Rik-202ENSMUST00000180906 2776 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Ppp3r1-201ENSMUST00000102880 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Slc38a6-206ENSMUST00000140523 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Pcsk7-209ENSMUST00000216672 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Ankrd60-201ENSMUST00000109112 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Colca2-201ENSMUST00000114427 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm13600-201ENSMUST00000117949 744 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm12990-201ENSMUST00000120372 468 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm12791-201ENSMUST00000120788 655 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 E130307A14Rik-203ENSMUST00000136862 608 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm10631-201ENSMUST00000153288 494 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm24992-201ENSMUST00000157412 130 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gstt3-203ENSMUST00000173537 687 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm28833-201ENSMUST00000189671 559 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Gm18514-201ENSMUST00000218980 436 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 AC153887.1-201ENSMUST00000219154 1253 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Mcts2-201ENSMUST00000062148 917 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Usp30Q3UN04 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms