Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Gm14592-201ENSMUST00000117201 560 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Rps19-ps10-201ENSMUST00000159750 435 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 4930535L15Rik-201ENSMUST00000175891 536 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm26134-201ENSMUST00000178484 110 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Iqcf3-202ENSMUST00000186668 633 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Fcer2a-206ENSMUST00000208438 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Fcer2a-208ENSMUST00000208603 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm45570-201ENSMUST00000211137 495 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Olfr1156-202ENSMUST00000216191 3300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Myo18a-221ENSMUST00000167856 6132 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ugt1a7c-201ENSMUST00000058237 3231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Phactr1-201ENSMUST00000066928 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm43482-201ENSMUST00000202797 1861 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm14892-201ENSMUST00000117636 267 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm15036-201ENSMUST00000118880 400 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm14275-201ENSMUST00000152112 430 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm25604-201ENSMUST00000158359 133 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm37284-201ENSMUST00000193607 539 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm44323-201ENSMUST00000198689 129 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm5599-201ENSMUST00000209602 788 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 CT009527.1-201ENSMUST00000224205 339 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Kif16b-201ENSMUST00000043589 6383 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Sp3-202ENSMUST00000102689 4181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm7538-201ENSMUST00000200918 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ap2b1-206ENSMUST00000176523 2742 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Mab21l2-201ENSMUST00000077524 2703 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 AC149588.2-201ENSMUST00000228182 1859 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Tmcc1-208ENSMUST00000173140 1910 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Dync1i2-201ENSMUST00000081710 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Xlr4c-204ENSMUST00000114531 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Cntrobos-201ENSMUST00000132834 383 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Snhg17-205ENSMUST00000151331 529 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 U2af1l4-218ENSMUST00000166960 747 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm35025-203ENSMUST00000193519 634 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Wnk1-203ENSMUST00000088644 11330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Rgs3-202ENSMUST00000084521 3888 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Lrrc55-201ENSMUST00000099930 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Maip1-201ENSMUST00000027114 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Tmem62-202ENSMUST00000110686 2417 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Atl2-202ENSMUST00000112437 3371 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm29358-202ENSMUST00000187941 3227 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 5730405O15Rik-201ENSMUST00000127521 1749 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 9430015G10Rik-201ENSMUST00000072554 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm5822-201ENSMUST00000161562 1378 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Zfp286-202ENSMUST00000108705 1979 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Dpep1-201ENSMUST00000019422 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Bbs2-201ENSMUST00000034206 3064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Acadsb-201ENSMUST00000015829 6081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Tcl1-202ENSMUST00000101071 1299 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Vmn1r-ps104-201ENSMUST00000120960 771 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm15744-201ENSMUST00000161734 213 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 H2al1i-201ENSMUST00000164729 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Tcl1-204ENSMUST00000176579 760 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 H2al1h-201ENSMUST00000177926 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 H2al1d-201ENSMUST00000178595 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 H2al1c-201ENSMUST00000178806 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 H2al1f-201ENSMUST00000179004 318 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Psenen-203ENSMUST00000207747 669 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm8436-201ENSMUST00000210152 1080 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Gm5749-201ENSMUST00000210673 1090 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Nt5dc1-206ENSMUST00000213269 802 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ints6l-207ENSMUST00000186445 3608 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ppp2r1b-201ENSMUST00000034560 3647 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Ppip5k1-202ENSMUST00000110625 5226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Usp19Q3UJD6 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.3 ms