Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Hsd17b3-201ENSMUST00000039832 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Aldoart2-201ENSMUST00000080123 1658 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Eif1a-201ENSMUST00000078079 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Abhd18-203ENSMUST00000159774 4455 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Llgl2-201ENSMUST00000103032 3551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gatb-203ENSMUST00000107674 1980 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 F10-201ENSMUST00000033821 1903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Trim34b-202ENSMUST00000180136 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nars-201ENSMUST00000025483 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Lmo7-201ENSMUST00000100337 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Atg9b-201ENSMUST00000059401 3902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fbxl12-203ENSMUST00000131128 4182 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm37660-201ENSMUST00000192754 1732 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Uhrf1bp1-201ENSMUST00000114849 8584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rasgrp4-205ENSMUST00000159975 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nr4a2-201ENSMUST00000028166 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gpr19-201ENSMUST00000046255 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Adh5-201ENSMUST00000005964 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Asap1-203ENSMUST00000110115 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm10842-201ENSMUST00000100338 369 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Olfr1263-201ENSMUST00000111507 1029 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Clps-202ENSMUST00000114785 369 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm9095-201ENSMUST00000117607 881 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm9097-201ENSMUST00000120514 880 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Spata3-205ENSMUST00000130504 1100 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 1700017J07Rik-201ENSMUST00000140241 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm20441-201ENSMUST00000173512 756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Higd1c-202ENSMUST00000177211 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm38324-201ENSMUST00000194390 411 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm44640-201ENSMUST00000206894 247 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rpl9-201ENSMUST00000057885 738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tmsb15b2-201ENSMUST00000069803 450 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm10020-201ENSMUST00000081993 612 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Phldb2-201ENSMUST00000036355 5483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ivns1abp-202ENSMUST00000097543 3337 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mccc1os-202ENSMUST00000137198 2686 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cyp2a4-201ENSMUST00000098657 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm27196-201ENSMUST00000184787 2582 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Adam20-201ENSMUST00000056331 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Nr1i3-201ENSMUST00000005820 1414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tkfc-201ENSMUST00000037678 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Dram1-201ENSMUST00000020249 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Bpgm-201ENSMUST00000045372 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Wdr81-204ENSMUST00000173320 6908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Camk2g-203ENSMUST00000100837 3564 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Arhgap25-202ENSMUST00000101197 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Herpud1-201ENSMUST00000034220 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Xpo1-201ENSMUST00000020538 5145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm8464-202ENSMUST00000146697 1142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm4750-201ENSMUST00000151942 1142 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Mylpf-206ENSMUST00000206772 653 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm18065-201ENSMUST00000221395 526 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cysrt1-201ENSMUST00000043379 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Aldoa-201ENSMUST00000032934 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Aldoa-202ENSMUST00000087566 1549 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ifi47-202ENSMUST00000109202 1773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Wfdc8-202ENSMUST00000109338 1794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Ube2v1-202ENSMUST00000109207 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Vmn1r198-203ENSMUST00000226909 6259 ntAPPRIS P2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Cavin1-201ENSMUST00000060792 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Kif22-ps-201ENSMUST00000119302 1984 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 1810019N24Rik-201ENSMUST00000181128 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Sf3b2Q3UJB0 Lrpprc-201ENSMUST00000112308 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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