Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

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Length 394 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Gm8752-201ENSMUST00000173427 1694 ntBASIC10.25□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.24□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC10.23□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Themis2-201ENSMUST00000045154 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Sorbs1-203ENSMUST00000165212 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Zfp36-201ENSMUST00000051241 2790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Riox2-206ENSMUST00000160571 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Gm13684-201ENSMUST00000152569 2264 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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Rnf149Q3U2C5 Lnx2-201ENSMUST00000016664 4557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Serpina1b-202ENSMUST00000164454 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Msra-201ENSMUST00000067927 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Zfp612-201ENSMUST00000058804 3180 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
Rnf149Q3U2C5 Rps10-203ENSMUST00000114882 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
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