Protein–RNA interactions for Protein: Q3TP92

Ctdnep1, CTD nuclear envelope phosphatase 1, mousemouse

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdnep1Q3TP92 Chrng-201ENSMUST00000027470 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ramp1-201ENSMUST00000097648 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pyurf-201ENSMUST00000053386 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Chek1-202ENSMUST00000172702 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tnip1-203ENSMUST00000102731 2973 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Fmnl1-202ENSMUST00000042286 3806 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tom1l2-202ENSMUST00000093046 4849 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tube1-201ENSMUST00000019991 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Akr1b8-201ENSMUST00000038406 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Camk1g-201ENSMUST00000016323 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm11706-201ENSMUST00000151282 316 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm23694-201ENSMUST00000179335 110 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Vmn1r220-201ENSMUST00000072385 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Arl16-201ENSMUST00000076921 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Tshz3-201ENSMUST00000021641 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43522-201ENSMUST00000196697 1922 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfyve1-203ENSMUST00000221919 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 March1-207ENSMUST00000110258 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Epha7-204ENSMUST00000108194 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Zc3hc1-201ENSMUST00000080812 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm9387-201ENSMUST00000098624 1320 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rps6ka1-209ENSMUST00000174481 2228 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Slc22a14-201ENSMUST00000093775 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 2810404F17Rik-201ENSMUST00000156615 1704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Kcnmb3-201ENSMUST00000164954 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Synj2-203ENSMUST00000115784 2634 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Usp22-201ENSMUST00000041683 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm44415-201ENSMUST00000204151 2112 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Thbs4-201ENSMUST00000022213 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Mgl2-205ENSMUST00000165951 1635 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ptp4a3-203ENSMUST00000165541 3539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gucy1a3-204ENSMUST00000193924 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Atraid-205ENSMUST00000201136 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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Ctdnep1Q3TP92 Folr2-203ENSMUST00000210598 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm40578-201ENSMUST00000220837 390 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Apoc4-201ENSMUST00000003071 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ntm-201ENSMUST00000075069 3022 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Arhgap11a-202ENSMUST00000110947 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ncstn-201ENSMUST00000003550 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Pfkp-201ENSMUST00000021614 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Zfp652-201ENSMUST00000091565 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Zim1-203ENSMUST00000203908 1740 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ccdc129-201ENSMUST00000044729 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 A530053M12Rik-201ENSMUST00000187918 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 C530008M17Rik-211ENSMUST00000163347 6835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 C530044C16Rik-201ENSMUST00000204275 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sgcb-201ENSMUST00000081170 3786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Ufd1-202ENSMUST00000115578 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Robo4-201ENSMUST00000102895 3226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Sorl1-201ENSMUST00000060989 10715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Fam47e-203ENSMUST00000146417 1357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 4833422M21Rik-203ENSMUST00000181747 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Apol9a-202ENSMUST00000089452 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctdnep1Q3TP92 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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