Protein–RNA interactions for Protein: Q3TIR1

Trappc13, Trafficking protein particle complex subunit 13, mousemouse

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Length 417 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc13Q3TIR1 Rab3gap2-204ENSMUST00000194740 4418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ptpn23-201ENSMUST00000040021 5346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Adra2b-202ENSMUST00000104934 4014 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rab13-202ENSMUST00000107373 1415 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 AC125374.1-201ENSMUST00000213573 1400 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Slc36a1-203ENSMUST00000108872 5264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tmem134-216ENSMUST00000171743 3701 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pdha1-201ENSMUST00000033662 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ighv1-58-201ENSMUST00000103529 351 ntAPPRIS P1 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm6039-201ENSMUST00000121667 1250 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm16001-201ENSMUST00000127989 875 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm11651-201ENSMUST00000130673 529 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 1500011K16Rik-201ENSMUST00000135091 800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 E130307A14Rik-204ENSMUST00000139356 701 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Prdx5-203ENSMUST00000149261 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm18734-201ENSMUST00000172937 808 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Swi5-207ENSMUST00000183946 768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm45881-201ENSMUST00000210659 517 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Fmnl1-207ENSMUST00000218163 3824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm6994-201ENSMUST00000088880 1163 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gem-202ENSMUST00000108304 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cyp26b1-202ENSMUST00000168003 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cyp26b1-201ENSMUST00000077705 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ptpn4-201ENSMUST00000064091 10874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ccdc32-201ENSMUST00000036470 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Btnl1-201ENSMUST00000080254 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Nin-201ENSMUST00000021468 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Prdm5-204ENSMUST00000172638 1714 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dcun1d3-202ENSMUST00000098080 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Slc25a51-201ENSMUST00000107796 4433 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Epha6-201ENSMUST00000068860 3930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dbh-201ENSMUST00000000910 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Lig1-211ENSMUST00000177588 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm15958-202ENSMUST00000153479 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Kdm3a-202ENSMUST00000167220 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Spice1-201ENSMUST00000050897 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Zscan10-201ENSMUST00000095595 2698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 B930036N10Rik-202ENSMUST00000181170 3544 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rab11fip4os1-201ENSMUST00000145652 2187 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Arpp21-223ENSMUST00000162097 3952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm5441-201ENSMUST00000186454 5181 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 5031434O11Rik-201ENSMUST00000180404 3731 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Tmem246-201ENSMUST00000042750 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Bzw1-201ENSMUST00000050552 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm5740-201ENSMUST00000211003 1857 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Steap3-201ENSMUST00000112639 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm15829-201ENSMUST00000145415 869 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Erh-202ENSMUST00000166931 506 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Bcar1-203ENSMUST00000212349 3116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Camk2a-203ENSMUST00000102888 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Lnx1-202ENSMUST00000087161 2753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pls3-201ENSMUST00000033547 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Acin1-203ENSMUST00000111484 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Hsd17b6-203ENSMUST00000219447 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rad17-201ENSMUST00000022136 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ankrd34c-202ENSMUST00000185470 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm10803-201ENSMUST00000099692 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Gm20425-201ENSMUST00000166836 3028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dnali1-201ENSMUST00000036383 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Fbxo40-201ENSMUST00000075869 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Rap1gap-201ENSMUST00000047243 3247 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ints10-201ENSMUST00000034328 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Dnmt3a-203ENSMUST00000111186 5424 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Fnbp1l-201ENSMUST00000162409 5198 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Trappc13Q3TIR1 Ablim1-210ENSMUST00000111550 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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