Protein–RNA interactions for Protein: Q1PSW8

Trim71, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM71, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim71Q1PSW8 Meltf-201ENSMUST00000023464 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Arhgap4-201ENSMUST00000064376 3353 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mfrp-201ENSMUST00000034654 4316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tbrg1-201ENSMUST00000117654 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Snai2-201ENSMUST00000023356 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Slc5a8-201ENSMUST00000020255 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Plagl2-201ENSMUST00000056924 5485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm26013-201ENSMUST00000104404 119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 A230006K03Rik-201ENSMUST00000107533 977 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Treml4-202ENSMUST00000125426 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Elof1-202ENSMUST00000166335 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Isl1-202ENSMUST00000176044 1198 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm7137-201ENSMUST00000180161 711 ntAPPRIS P1 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm37406-201ENSMUST00000192478 500 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm31166-202ENSMUST00000210638 1268 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm3028-201ENSMUST00000213805 1119 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm32828-202ENSMUST00000219198 2111 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tff2-201ENSMUST00000024826 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Il1rap-206ENSMUST00000174202 2306 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Aldh3a2-203ENSMUST00000108715 2578 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pla2g15-201ENSMUST00000034377 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 4632427E13Rik-202ENSMUST00000147198 6559 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm8522-201ENSMUST00000118416 1929 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Abca3-202ENSMUST00000079594 6380 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zmynd11-206ENSMUST00000110637 3770 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Stxbp6-202ENSMUST00000120531 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm26794-201ENSMUST00000180810 4312 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm15609-201ENSMUST00000155610 2960 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Poc5-201ENSMUST00000099295 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Sema4c-208ENSMUST00000195620 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm15172-201ENSMUST00000118945 1046 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps7-201ENSMUST00000140507 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm16347-202ENSMUST00000149000 772 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm10807-201ENSMUST00000177134 795 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm7593-201ENSMUST00000187246 644 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm8531-201ENSMUST00000188319 893 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AA545190-201ENSMUST00000203495 1053 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm3793-201ENSMUST00000204973 672 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Krtap4-2-201ENSMUST00000058987 974 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rpl9-ps4-201ENSMUST00000075549 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm5451-201ENSMUST00000080545 579 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm25517-201ENSMUST00000083865 134 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rab14-202ENSMUST00000113025 4346 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Aldoc-202ENSMUST00000102478 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Stx5a-213ENSMUST00000176381 2251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gck-201ENSMUST00000102920 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Stra6-202ENSMUST00000085677 2725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Kcnh6-202ENSMUST00000106903 2816 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Slurp1-202ENSMUST00000190433 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Prune1-201ENSMUST00000015855 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Maml2-202ENSMUST00000159294 6404 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Cdc37l1-201ENSMUST00000050148 5179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Fosb-201ENSMUST00000003640 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Prkag3-206ENSMUST00000188073 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Fer1l4-201ENSMUST00000109611 6106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tcp11l1-202ENSMUST00000111118 5474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Tpra1-218ENSMUST00000203185 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Ccdc15-204ENSMUST00000216042 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Hnrnpc-206ENSMUST00000227458 1683 ntAPPRIS ALT1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Rad9b-201ENSMUST00000049009 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pip5kl1-201ENSMUST00000055304 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pcdhb17-201ENSMUST00000053856 4660 ntAPPRIS P1 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Trim71Q1PSW8 Pnpla6-212ENSMUST00000208002 4444 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms